RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM26D	Q5JW98	314 aa		24.78	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		24.78	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		24.78	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		24.78	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		24.78	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		24.78	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	CA3	P07451	260 aa		24.78	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	CIITA	P33076	1130 aa		24.78	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNJ6	P48051	423 aa		24.78	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFB103A	P81534	67 aa		24.78	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	24.78	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	IKBKE	Q14164	716 aa		24.78	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	GRIK4	Q16099	956 aa		24.78	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		24.78	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		24.78	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	24.77	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	CPLX1	O14810	134 aa		24.77	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	EFCAB14	O75071	495 aa		24.77	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	DEXI	O95424	95 aa		24.77	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	CTSH	P09668	335 aa		24.77	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	STK3	Q13188	491 aa		24.77	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	ADGRE1	Q14246	886 aa		24.77	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		24.77	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	24.77	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	AZI2	Q9H6S1	392 aa		24.77	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	SI	P14410	1827 aa		24.77	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGEF15	O94989	841 aa		24.76	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	INSRR	P14616	1297 aa		24.76	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	STAT5B	P51692	787 aa		24.76	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	24.76	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	PLCB4	Q15147	1175 aa		24.76	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		24.76	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	LENG9	Q96B70	501 aa		24.76	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		24.76	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		24.76	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		24.75	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	CHRNA1	P02708	482 aa		24.75	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	SCRN1	Q12765	414 aa		24.75	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	24.75	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF28P	B7ZC32	967 aa		24.74	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200		M0R2N6	131 aa		24.74	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	24.74	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	GJB5	O95377	273 aa		24.74	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	NPY5R	Q15761	445 aa		24.74	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	24.74	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	24.74	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		24.74	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		24.74	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		24.73	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	PFKFB2	O60825	505 aa		24.73	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC26A2	P50443	739 aa		24.73	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	NLRP5	P59047	1200 aa		24.73	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	TAP1	Q03518	808 aa		24.73	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	MGAT3	Q09327	533 aa		24.73	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR16	Q569H4	304 aa		24.73	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	24.73	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	24.73	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	AIFM3	Q96NN9	605 aa		24.73	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	UIMC1	Q96RL1	719 aa		24.73	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		24.73	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	TLL1	O43897	1013 aa		24.72	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	USP11	P51784	963 aa		24.72	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	24.72	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	USP38	Q8NB14	1042 aa		24.72	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		24.72	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		24.72	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	TRPC6	Q9Y210	931 aa		24.72	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR81	Q562E7	1941 aa		24.72	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	24.72	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	24.71	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	LCHN	A4D1U4	455 aa		24.71	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	SEC24B	O95487	1268 aa		24.71	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	AK2	P54819	239 aa		24.71	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	IGBP1	P78318	339 aa		24.71	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		24.71	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	SEPT8	Q92599	483 aa		24.71	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	24.71	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	24.71	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC28	Q96AY4	2481 aa		24.71	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	POTEB3	A0JP26	581 aa		24.7	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	GALNT17	Q6IS24	598 aa		24.7	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	24.7	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	POTEB	Q6S5H4	581 aa		24.7	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		24.7	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	RAD9A	Q99638	391 aa		24.7	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	MUC3A	Q02505	3323 aa		24.7	■■□□□ 1.55
PPP4C-205	ENST00000563200	EPOP	A6NHQ4	379 aa		24.69	■■□□□ 1.54
PPP4C-205	ENST00000563200	CTDNEP1	O95476	244 aa		24.69	■■□□□ 1.54
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP4A	P20648	1035 aa		24.69	■■□□□ 1.54
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD1	Q15327	319 aa		24.69	■■□□□ 1.54
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		24.69	■■□□□ 1.54
PPP4C-205	ENST00000563200	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		24.69	■■□□□ 1.54
PPP4C-205	ENST00000563200	SPRED2	Q7Z698	418 aa		24.69	■■□□□ 1.54
PPP4C-205	ENST00000563200	RSPH3	Q86UC2	560 aa		24.69	■■□□□ 1.54
PPP4C-205	ENST00000563200	BLID	Q8IZY5	108 aa		24.69	■■□□□ 1.54
PPP4C-205	ENST00000563200	TBCK	Q8TEA7	893 aa		24.69	■■□□□ 1.54
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		24.69	■■□□□ 1.54
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF302	Q9NR11	478 aa		24.69	■■□□□ 1.54
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		24.69	■■□□□ 1.54
PPP4C-205	ENST00000563200	STK36	Q9NRP7	1315 aa		24.69	■■□□□ 1.54

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