RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 PPFIA1Q13136 1202 aa23.68■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 LRCH2Q5VUJ6 765 aa23.68■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa23.68■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa23.68■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 ETNPPLQ8TBG4 499 aa23.68■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 IQCF3P0C7M6 154 aa23.67■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 ADAM17P78536 824 aa23.67■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP23.67■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 LRIT3Q3SXY7 679 aa23.67■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM240Q5SV17 173 aa23.67■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 PPP4R3AQ6IN85 833 aa23.67■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 AFAP1L1Q8TED9 768 aa23.67■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 TEKT3Q9BXF9 490 aa23.67■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 PSMD10O75832 226 aa23.66■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 CKBP12277 381 aa23.66■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 SELPP16109 830 aa23.66■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 PLCB4Q15147 1175 aa23.66■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 GRIK4Q16099 956 aa23.66■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 FAM160B1Q5W0V3 765 aa23.66■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 SWSAP1Q6NVH7 229 aa23.66■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF365Q70YC5 407 aa23.66■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.66■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 VWCEQ96DN2 955 aa23.66■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF302Q9NR11 478 aa23.66■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 TRPC6Q9Y210 931 aa23.66■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.66■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 TANC1Q9C0D5 1861 aa23.65■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 WDR64B1ANS9 1081 aa23.65■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 CHMP2AO43633 222 aa23.65■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 SLC26A2P50443 739 aa23.65■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 LRRC8DQ7L1W4 858 aa23.65■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 UNC45AQ9H3U1 944 aa23.65■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 KCNMB3Q9NPA1 279 aa23.65■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 SAMM50Q9Y512 469 aa23.65■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
TMOD3-203ENST00000558455 PSAPP07602 524 aa23.64■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 INSRRP14616 1297 aa23.64■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 RFC2P35250 354 aa23.64■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 PDXDC2PQ6P474 469 aa23.64■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 DEFB128Q7Z7B8 93 aa23.64■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
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TMOD3-203ENST00000558455 POTEB3A0JP26 581 aa23.63■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 PFKMP08237 780 aa23.63■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 THPOP40225 353 aa23.63■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 IGBP1P78318 339 aa23.63■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 MARCH8Q5T0T0 291 aa23.63■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF618Q5T7W0 954 aa23.63■■□□□ 1.37
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TMOD3-203ENST00000558455 POTEBQ6S5H4 581 aa23.63■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 POTEDQ86YR6 584 aa23.63■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 ATP8B4Q8TF62 1192 aa23.63■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 LRCH3Q96II8 777 aa23.63■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 TUBE1Q9UJT0 475 aa23.63■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
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TMOD3-203ENST00000558455 WNT7AO00755 349 aa23.62■■□□□ 1.37
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TMOD3-203ENST00000558455 SFNP31947 248 aa23.62■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 JAK3P52333 1124 aa23.62■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 B3GNT9Q6UX72 402 aa23.62■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 RUFY4Q6ZNE9 571 aa23.62■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 FAM20AQ96MK3 541 aa23.62■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 GABBR1Q9UBS5 961 aa23.62■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 KIF3AQ9Y496 699 aa23.62■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa23.61■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 SCN5AQ14524 2016 aa23.61■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 RRN3P2A6NIE6 340 aa23.61■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 TBX3O15119 743 aa23.61■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 ATP4AP20648 1035 aa23.61■■□□□ 1.37
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TMOD3-203ENST00000558455 RASIP1Q5U651 963 aa23.61■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 OTOP2Q7RTS6 562 aa23.61■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 MIER3Q7Z3K6 550 aa23.61■■□□□ 1.37
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TMOD3-203ENST00000558455 CAND2O75155 1236 aa23.6■■□□□ 1.37
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TMOD3-203ENST00000558455 TAF2Q6P1X5 1199 aa23.6■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 RDM1Q8NG50 284 aa23.6■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 VAV3Q9UKW4 847 aa23.6■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 KIF28PB7ZC32 967 aa23.59■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa23.59■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 NBNO60934 754 aa23.59■■□□□ 1.37
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