RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551676.5

PPP1CC-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, human

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CC-208	ENST00000551676	HPS3	Q969F9	1004 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PPP1CC-208	ENST00000551676	SAMM50	Q9Y512	469 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZBTB39	O15060	712 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	SLC10A3	P09131	477 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	WDR78	Q5VTH9	848 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	SP2	Q02086	613 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	HS1BP3	Q53T59	392 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	C4orf19	Q8IY42	314 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	KCND2	Q9NZV8	630 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	STRN	O43815	780 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	PSMC5	P62195	406 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	REEP2	Q9BRK0	252 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	28.61	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	TGFB3	P10600	412 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	CCNE1	P24864	410 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	IFNK	Q9P0W0	207 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	INHBE	P58166	350 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	TTI2	Q6NXR4	508 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	P2RX5	Q93086	422 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	UGCG	Q16739	394 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	BICDL2	A1A5D9	508 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	PSAP	P07602	524 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	GUCY2C	P25092	1073 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	ACTR2	P61160	394 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	CENPP	Q6IPU0	288 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	ASB14	A6NK59	587 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	CBFA2T2	O43439	604 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	COBL	O75128	1261 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	ATG7	O95352	703 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	ADORA2A	P29274	412 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	CCDC102A	Q96A19	550 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PPP1CC-208	ENST00000551676	SERPINC1	P01008	464 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	GAP43	P17677	238 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	MAPK4	P31152	587 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	28.56	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	UBASH3A	P57075	661 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	NEDD9	Q14511	834 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	GPR142	Q7Z601	462 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	RARRES1	P49788	294 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	GRB14	Q14449	540 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	IFNL1	Q8IU54	200 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
PPP1CC-208	ENST00000551676	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		28.55	■■■□□ 2.16

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