RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 OXER1Q8TDS5 423 aa23.71■■□□□ 1.39
CS-222ENST00000550996 ZBTB10Q96DT7 871 aa23.71■■□□□ 1.39
CS-222ENST00000550996 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.71■■□□□ 1.39
CS-222ENST00000550996 SEMA6BQ9H3T3 888 aa23.71■■□□□ 1.39
CS-222ENST00000550996 ZBBXA8MT70 800 aa23.7■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 USP11P51784 963 aa23.7■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 PLCB4Q15147 1175 aa23.7■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 GRIK4Q16099 956 aa23.7■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa23.7■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 EYSQ5T1H1 3165 aa23.69■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 MSH4O15457 936 aa23.69■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 TDP2O95551 362 aa23.69■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 GNAT1P11488 350 aa23.69■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa23.69■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 GJA10Q969M2 543 aa23.69■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 AZI2Q9H6S1 392 aa23.69■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
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CS-222ENST00000550996 RSPH10BP0C881 870 aa23.68■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 INSRRP14616 1297 aa23.68■■□□□ 1.38
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CS-222ENST00000550996 RABGGTBP53611 331 aa23.68■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 TIFAQ96CG3 184 aa23.68■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.68■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 TBC1D22BQ9NU19 505 aa23.68■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa23.67■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 PARNO95453 639 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 CYP3A7P24462 503 aa23.67■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 INF2Q27J81 1249 aa23.67■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa23.67■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 MBOAT7Q96N66 472 aa23.67■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 TUBE1Q9UJT0 475 aa23.67■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 TMEM265A0A087WTH1 108 aa23.66■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 ACTN1P12814 892 aa23.66■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 MYOGP15173 224 aa23.66■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 ATP4AP20648 1035 aa23.66■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 IGBP1P78318 339 aa23.66■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.66■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 Q4G0T1 1027 aa23.66■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.66■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 SLC5A5Q92911 643 aa23.66■■□□□ 1.38
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CS-222ENST00000550996 TRPC6Q9Y210 931 aa23.66■■□□□ 1.38
CS-222ENST00000550996 FAM205CA6NFA0 338 aa23.65■■□□□ 1.38
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CS-222ENST00000550996 SWSAP1Q6NVH7 229 aa23.65■■□□□ 1.38
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CS-222ENST00000550996 DNAJB3Q8WWF6 145 aa23.63■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 RIT2Q99578 217 aa23.63■■□□□ 1.37
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CS-222ENST00000550996 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa23.63■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 RRN3P2A6NIE6 340 aa23.62■■□□□ 1.37
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