RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547701.5

CTDSP2-203, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-203ENST00000547701 GLG1Q92896 1179 aa26.38■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 BACH2Q9BYV9 841 aa26.38■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa26.37■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 RRN3P2A6NIE6 340 aa26.37■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 JAK2O60674 1132 aa26.37■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 MCM2P49736 904 aa26.37■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 GPNMBQ14956 572 aa26.37■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 LMBR1Q8WVP7 490 aa26.37■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 SCLYQ96I15 445 aa26.37■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 BRMS1Q9HCU9 246 aa26.37■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 GJB4Q9NTQ9 266 aa26.37■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 TREHO43280 583 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 PSMD10O75832 226 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 KRT2P35908 639 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 TAF2Q6P1X5 1199 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 LRRC8DQ7L1W4 858 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 NEK8Q86SG6 692 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 RDM1Q8NG50 284 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 ETNPPLQ8TBG4 499 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 OXER1Q8TDS5 423 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 SETD4Q9NVD3 440 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 TBX3O15119 743 aa26.35■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 INF2Q27J81 1249 aa26.35■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 FAM26DQ5JW98 314 aa26.35■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 FAM160B1Q5W0V3 765 aa26.35■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 CCDC83Q8IWF9 413 aa26.35■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 WNT8BQ93098 351 aa26.35■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 LRCH3Q96II8 777 aa26.35■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 ACRP10323 421 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 SFNP31947 248 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 PPFIA1Q13136 1202 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 PLCB4Q15147 1175 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 MARCH8Q5T0T0 291 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 KRT40Q6A162 431 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 FAM20AQ96MK3 541 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 KCNMB3Q9NPA1 279 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 TMEM265A0A087WTH1 108 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 HBP1O60381 514 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 TDP2O95551 362 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 GRIK4Q16099 956 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF618Q5T7W0 954 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDSP2-203ENST00000547701 COL1A2P08123 1366 aa26.33■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 WDR64B1ANS9 1081 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 BAIAP3O94812 1187 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 PSAPP07602 524 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 INSRRP14616 1297 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 TRIM29Q14134 588 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 ATP8B4Q8TF62 1192 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF302Q9NR11 478 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 POTEB3A0JP26 581 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 GAS7O60861 476 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 ACTN1P12814 892 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 JAK3P52333 1124 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 NR5A1Q13285 461 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 LRCH2Q5VUJ6 765 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 POTEBQ6S5H4 581 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 TEKT3Q9BXF9 490 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 TUBE1Q9UJT0 475 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 RSPH10B2B2RC85 870 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 BTBD18B2RXH4 712 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 NBNO60934 754 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 RSPH10BP0C881 870 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 ATP4AP20648 1035 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 MBTPS1Q14703 1052 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 LETM2Q2VYF4 491 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 SWSAP1Q6NVH7 229 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 DISC1Q9NRI5 854 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 DTNBO60941 627 aa26.29■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 MARK3P27448 753 aa26.29■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF484Q5JVG2 852 aa26.29■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 PDXDC2PQ6P474 469 aa26.29■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 TMX3Q96JJ7 454 aa26.29■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 BACH1O14867 736 aa26.28■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC37A4O43826 429 aa26.28■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 EFCAB14O75071 495 aa26.28■■□□□ 1.8
CTDSP2-203ENST00000547701 THPOP40225 353 aa26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms