RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537568.1

LMO3-216, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 594 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-216ENST00000537568 LILRB2Q8N423 598 aa9.64□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 GATAD2BQ8WXI9 593 aa9.64□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 BADQ92934 168 aa9.64□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 RUSC1Q9BVN2 902 aa9.64□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 SPC25Q9HBM1 224 aa9.64□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa9.64□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa9.64□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 GPR179Q6PRD1 2367 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 GSC2O15499 205 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 HMGCRP04035 888 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 PTMSP20962 102 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 ITGB8P26012 769 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 GIPRP48546 466 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 ZNF165P49910 485 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 MMP14P50281 582 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 DDR2Q16832 855 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 ANKRD34AQ69YU3 496 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 TIFAQ96CG3 184 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 LRRC3Q9BY71 257 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 CCDC113Q9H0I3 377 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 C7orf69Q9H7B7 122 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 MSRB2Q9Y3D2 182 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 DMXL1Q9Y485 3027 aa9.62□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 ESYT3A0FGR9 886 aa9.62□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 HMX2A2RU54 273 aa9.62□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 ERC2O15083 957 aa9.62□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 SART1O43290 800 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 PPP2R3AQ06190 1150 aa9.62□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 PPIL2Q13356 520 aa9.62□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 MPP2Q14168 576 aa9.62□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 DLGAP5Q15398 846 aa9.62□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 RASIP1Q5U651 963 aa9.62□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 ERO1BQ86YB8 467 aa9.62□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 CERS5Q8N5B7 392 aa9.62□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 APPBP2Q92624 585 aa9.62□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 UIMC1Q96RL1 719 aa9.62□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 BRINP2Q9C0B6 783 aa9.62□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 VEZTQ9HBM0 779 aa9.62□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 BRMS1Q9HCU9 246 aa9.62□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 PCDH12Q9NPG4 1184 aa9.62□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa9.62□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 SAMM50Q9Y512 469 aa9.62□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 LRRC37A2A6NM11 1700 aa9.62□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 FAM186AA6NE01 2351 aa9.61□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 PDPK1O15530 556 aa9.61□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 BPNT1O95861 308 aa9.61□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 NFIAQ12857 509 aa9.61□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 FDX2Q6P4F2 183 aa9.61□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 FAM20CQ8IXL6 584 aa9.61□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa9.61□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 BRWD1Q9NSI6 2320 aa9.6□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 FAM221AA4D161 298 aa9.6□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 PLIN1O60240 522 aa9.6□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 TGFB1P01137 390 aa9.6□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 BMP3P12645 472 aa9.6□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 SSTR4P31391 388 aa9.6□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 CLCQ05315 142 aa9.6□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 PPP2R5EQ16537 467 aa9.6□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 HOMER1Q86YM7 354 aa9.6□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 PRSS33Q8NF86 280 aa9.6□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 TRIB2Q92519 343 aa9.6□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 USP26Q9BXU7 913 aa9.6□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 CBX8Q9HC52 389 aa9.6□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 KLHL42Q9P2K6 505 aa9.6□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 GJD2Q9UKL4 321 aa9.6□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 CSADQ9Y600 493 aa9.6□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 MED23Q9ULK4 1368 aa9.6□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 USP24Q9UPU5 2620 aa9.59□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa9.59□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 MEGF11A6BM72 1044 aa9.59□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 TRIM43BA6NCK2 446 aa9.59□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 BMP6P22004 513 aa9.59□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 CD97P48960 835 aa9.59□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 RTP1P59025 263 aa9.59□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 AAK1Q2M2I8 961 aa9.59□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 CFAP100Q494V2 611 aa9.59□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 REC114Q7Z4M0 266 aa9.59□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa9.59□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 OR6P1Q8NGX9 317 aa9.59□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 RUNDC1Q96C34 613 aa9.59□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 CFAP53Q96M91 514 aa9.59□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 TMEM39BQ9GZU3 492 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.2 ms