RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533413.5

CKAP5-212, Transcript of cytoskeleton associated protein 5, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CKAP5, Length 3,084 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5-212ENST00000533413 PSMA3P25788 255 aa5.96□□□□□ -1.45
CKAP5-212ENST00000533413 CHRNDQ07001 517 aa5.96□□□□□ -1.45
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CKAP5-212ENST00000533413 TMED1Q13445 227 aa5.96□□□□□ -1.45
CKAP5-212ENST00000533413 TUBB2AQ13885 445 aa5.96□□□□□ -1.45
CKAP5-212ENST00000533413 AOC3Q16853 763 aa5.96□□□□□ -1.45
CKAP5-212ENST00000533413 SLC5A9Q2M3M2 681 aa5.96□□□□□ -1.45
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CKAP5-212ENST00000533413 LRRC24Q50LG9 513 aa5.95□□□□□ -1.46
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CKAP5-212ENST00000533413 TC2NQ8N9U0 490 aa5.95□□□□□ -1.46
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CKAP5-212ENST00000533413 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
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CKAP5-212ENST00000533413 AIFM3Q96NN9 605 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 GSDMAQ96QA5 445 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 DNAI2Q9GZS0 605 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 FAM107BQ9H098 131 aa5.95□□□□□ -1.46
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