RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532612.5

BCO2-215, Transcript of beta-carotene oxygenase 2, human

TSL 1 (best)

Gene BCO2, Length 635 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BCO2-215	ENST00000532612	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	CLIC4	Q9Y696	253 aa		12.7	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	LTBP2	Q14767	1821 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	EMSY	Q7Z589	1322 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	PSAP	P07602	524 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	CAPN2	P17655	700 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	TEC	P42680	631 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	JAK3	P52333	1124 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	CYP4A11	Q02928	519 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	USP28	Q96RU2	1077 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	TRPC6	Q9Y210	931 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	SCN5A	Q14524	2016 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	ARVCF	O00192	962 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	LGR5	O75473	907 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	STAT5B	P51692	787 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	IGBP1	P78318	339 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	TLE2	Q04725	743 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	PPP2R5C	Q13362	524 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	C7orf31	Q8N865	590 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	LRCH3	Q96II8	777 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	DYDC2	Q96IM9	177 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	COL6A3	P12111	3177 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	SI	P14410	1827 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	TMEM150B	A6NC51	233 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	HAS3	O00219	553 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	EVI5	O60447	810 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	B4GALT4	O60513	344 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	ATG7	O95352	703 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	BRD1	O95696	1058 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	SFN	P31947	248 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	PRKCE	Q02156	737 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	HIC1	Q14526	733 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	SNX17	Q15036	470 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	PLCB4	Q15147	1175 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	RGL1	Q9NZL6	768 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	NOD1	Q9Y239	953 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	PP2D1	A8MPX8	630 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	CYP2C9	P11712	490 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	SYN1	P17600	705 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	ATP4A	P20648	1035 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	GRIN1	Q05586	938 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	PPFIA1	Q13136	1202 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	IL17A	Q16552	155 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	LXN	Q9BS40	222 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	SETD4	Q9NVD3	440 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BCO2-215	ENST00000532612	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		12.65	□□□□□ -0.38

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