RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532308.5

TSTA3-215, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 951 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-215ENST00000532308 NFKBIBQ15653 356 aa22.9■■□□□ 1.26
TSTA3-215ENST00000532308 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
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TSTA3-215ENST00000532308 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.9■■□□□ 1.26
TSTA3-215ENST00000532308 TPH2Q8IWU9 490 aa22.9■■□□□ 1.26
TSTA3-215ENST00000532308 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.9■■□□□ 1.26
TSTA3-215ENST00000532308 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TSTA3-215ENST00000532308 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TSTA3-215ENST00000532308 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.9■■□□□ 1.26
TSTA3-215ENST00000532308 AZI2Q9H6S1 392 aa22.9■■□□□ 1.26
TSTA3-215ENST00000532308 ZNF302Q9NR11 478 aa22.9■■□□□ 1.26
TSTA3-215ENST00000532308 RGL1Q9NZL6 768 aa22.9■■□□□ 1.26
TSTA3-215ENST00000532308 GABBR1Q9UBS5 961 aa22.9■■□□□ 1.26
TSTA3-215ENST00000532308 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.9■■□□□ 1.26
TSTA3-215ENST00000532308 A6NJR5 290 aa22.89■■□□□ 1.25
TSTA3-215ENST00000532308 MMP3P08254 477 aa22.89■■□□□ 1.25
TSTA3-215ENST00000532308 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.89■■□□□ 1.25
TSTA3-215ENST00000532308 NDUFA8P51970 172 aa22.89■■□□□ 1.25
TSTA3-215ENST00000532308 CYP4A11Q02928 519 aa22.89■■□□□ 1.25
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TSTA3-215ENST00000532308 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
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TSTA3-215ENST00000532308 POTEFA5A3E0 1075 aa22.88■■□□□ 1.25
TSTA3-215ENST00000532308 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
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TSTA3-215ENST00000532308 NKX3-2P78367 333 aa22.88■■□□□ 1.25
TSTA3-215ENST00000532308 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.88■■□□□ 1.25
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TSTA3-215ENST00000532308 POTEBQ6S5H4 581 aa22.88■■□□□ 1.25
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TSTA3-215ENST00000532308 IQUBQ8NA54 791 aa22.88■■□□□ 1.25
TSTA3-215ENST00000532308 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.88■■□□□ 1.25
TSTA3-215ENST00000532308 PNMA5Q96PV4 448 aa22.88■■□□□ 1.25
TSTA3-215ENST00000532308 LXNQ9BS40 222 aa22.88■■□□□ 1.25
TSTA3-215ENST00000532308 PANK2Q9BZ23 570 aa22.88■■□□□ 1.25
TSTA3-215ENST00000532308 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.88■■□□□ 1.25
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TSTA3-215ENST00000532308 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa22.87■■□□□ 1.25
TSTA3-215ENST00000532308 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa22.87■■□□□ 1.25
TSTA3-215ENST00000532308 KPNA6O60684 536 aa22.87■■□□□ 1.25
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TSTA3-215ENST00000532308 PLCG1P19174 1290 aa22.86■■□□□ 1.25
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TSTA3-215ENST00000532308 RNF208Q9H0X6 261 aa22.85■■□□□ 1.25
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TSTA3-215ENST00000532308 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
TSTA3-215ENST00000532308 CTAGE5O15320 804 aa22.84■■□□□ 1.25
TSTA3-215ENST00000532308 NR1I2O75469 434 aa22.84■■□□□ 1.25
TSTA3-215ENST00000532308 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
TSTA3-215ENST00000532308 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
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