RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525861.5

ACER3-204, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 2,058 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-204ENST00000525861 FAM114A1Q8IWE2 563 aa25.79■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 CDHR1Q96JP9 859 aa25.79■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 ZHX3Q9H4I2 956 aa25.79■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa25.79■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 TBC1D7Q9P0N9 293 aa25.79■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 SAMM50Q9Y512 469 aa25.79■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa25.79■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 N4BP3O15049 544 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 ZBTB39O15060 712 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 PBX1P40424 430 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 JAK3P52333 1124 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 CCZ1BP86790 482 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 C1orf186Q6ZWK4 172 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 NCAPG2Q86XI2 1143 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 TAB2Q9NYJ8 693 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 KCND2Q9NZV8 630 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 KIF20AO95235 890 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 SLC25A27O95847 323 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 SFNP31947 248 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 FKBP1BP68106 108 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 CREBRFQ8IUR6 639 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 RRAGCQ9HB90 399 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 TBCAO75347 108 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 GNPTABQ3T906 1256 aa25.77■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 VPS16Q9H269 839 aa25.77■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa25.77■■□□□ 1.72
ACER3-204ENST00000525861 WDR64B1ANS9 1081 aa25.76■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 SKILP12757 684 aa25.76■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 COPB2P35606 906 aa25.76■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 QARSP47897 775 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 CNTN2Q02246 1040 aa25.76■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 SFR1Q86XK3 245 aa25.76■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 RDM1Q8NG50 284 aa25.76■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 TSG101Q99816 390 aa25.76■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 TXNRD2Q9NNW7 524 aa25.76■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 RBPJLQ9UBG7 517 aa25.76■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 ASTN1O14525 1302 aa25.76■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 LYPLA2O95372 231 aa25.76■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 CCNE2O96020 404 aa25.76■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 KCNA2P16389 499 aa25.76■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 SCFD1Q8WVM8 642 aa25.76■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 RSPH10B2B2RC85 870 aa25.75■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 RSPH10BP0C881 870 aa25.75■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 GAP43P17677 238 aa25.75■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 ERCC3P19447 782 aa25.75■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP25.75■■□□□ 1.712e-7■■■■■ 40.8
ACER3-204ENST00000525861 STXBP2Q15833 593 aa25.75■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 ZCWPW2Q504Y3 356 aa25.75■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 SENP7Q9BQF6 1050 aa25.75■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 SPTLC3Q9NUV7 552 aa25.75■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 NFASCO94856 1347 aa25.74■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 ARHGEF35A5YM69 484 aa25.74■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 POTEB2H3BUK9 544 aa25.74■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 EEF2KMTQ96G04 330 aa25.74■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 OLFML3Q9NRN5 406 aa25.74■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 PNMA3Q9UL41 463 aa25.74■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 ITIH6Q6UXX5 1313 aa25.74■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa25.73■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 ODF2LQ9ULJ1 636 aa25.73■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 LGALS16A8MUM7 142 aa25.73■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 NRDCO43847 1150 aa25.73■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 GUCY2CP25092 1073 aa25.73■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 LRRC55Q6ZSA7 311 aa25.73■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 C4orf19Q8IY42 314 aa25.73■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 FAM133AQ8N9E0 248 aa25.73■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa25.73■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 FAM13AO94988 1023 aa25.72■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 CASP5P51878 434 aa25.72■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 PSMC5P62195 406 aa25.72■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 Q3C1V9 767 aa25.72■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 KCTD10Q9H3F6 313 aa25.72■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa25.72■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 CETPP11597 493 aa25.72■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 EDNRBP24530 442 aa25.72■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 ICAM3P32942 547 aa25.72■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 ZNF131P52739 623 aa25.72■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 NELFCDQ8IXH7 590 aa25.72■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 CCDC112Q8NEF3 446 aa25.72■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.72■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 PARVGQ9HBI0 331 aa25.72■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 SOWAHBA6NEL2 793 aa25.71■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 TPM2P07951 284 aa25.71■■□□□ 1.71
ACER3-204ENST00000525861 GTF2A2P52657 109 aa25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms