RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519813.1

TMPRSS4-208, Transcript of transmembrane serine protease 4, humanhuman

TSL 5

Gene TMPRSS4, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4-208ENST00000519813 LRRC15Q8TF66 581 aa8.01□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 SCFD1Q8WVM8 642 aa8.01□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 LPAR1Q92633 364 aa8.01□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 HOOK2Q96ED9 719 aa8.01□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 FAM81BQ96LP2 452 aa8.01□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 CPVLQ9H3G5 476 aa8.01□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 TMEM206Q9H813 350 aa8.01□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa8.01□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 USP17L15C9J2P7 530 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 USP17L13C9JLJ4 530 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 USP17L11C9JVI0 530 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 USP17L18D6R9N7 530 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 USP17L22D6RA61 530 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 USP17L17D6RBQ6 530 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 USP17L19D6RCP7 530 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 USP17L20D6RJB6 530 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 MEIS1O00470 390 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 OPA1O60313 960 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 RPS6KA5O75582 802 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 LYPLA2O95372 231 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 IVLP07476 585 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 ASNSP08243 561 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 FERP16591 822 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 GUCY2CP25092 1073 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 EIF6P56537 245 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 KLHL30Q0D2K2 578 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 USP17L24Q0WX57 530 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 NFIAQ12857 509 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 IKQ13123 557 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 CASP8Q14790 479 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 DLGAP5Q15398 846 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 UBE2SQ16763 222 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 EXOC3L4Q17RC7 722 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 CEP55Q53EZ4 464 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 PRR16Q569H4 304 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 CCDC181Q5TID7 509 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 EMBQ6PCB8 327 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 USP17L6PQ6QN14 398 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 KIAA0825Q8IV33 1275 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 C12orf56Q8IXR9 622 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 IFT20Q8IY31 132 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 RDM1Q8NG50 284 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 CAGE1Q8TC20 777 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 SLC5A5Q92911 643 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 NUDT12Q9BQG2 462 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 DNAJC18Q9H819 358 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 VCPKMTQ9H867 229 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 PRR12Q9ULL5 1215 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 USP20Q9Y2K6 914 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa8□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 SPDYE2BA6NHP3 402 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 LRRC53A6NM62 1247 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 E9PMD0 336 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 MSH4O15457 936 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 MED24O75448 989 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 PSMD10O75832 226 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 GH2P01242 217 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 SPDYE6P0CI01 402 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 LMNB1P20700 586 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 NR2F2P24468 414 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 STAT1P42224 750 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 PRELPP51888 382 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 ZNF131P52739 623 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 TNFAIP1Q13829 316 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 ASIC2Q16515 512 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 ECM1Q16610 540 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 ARSHQ5FYA8 562 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 HGSNATQ68CP4 663 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 RINT1Q6NUQ1 792 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 C1orf186Q6ZWK4 172 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 KCNK18Q7Z418 384 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 USP37Q86T82 979 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 CREG2Q8IUH2 290 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 TTLL6Q8N841 843 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 SPATA4Q8NEY3 305 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 MORC4Q8TE76 937 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 COG1Q8WTW3 980 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 TBC1D5Q92609 795 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 LENG9Q96B70 501 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 SPAG5Q96R06 1193 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 CSRNP1Q96S65 589 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 OSBPL9Q96SU4 736 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 STK33Q9BYT3 514 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 LACRTQ9GZZ8 138 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa7.99□□□□□ -1.13
TMPRSS4-208ENST00000519813 DBNDD1Q9H9R9 158 aa7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms