RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519004.5

PABPC1-208, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PABPC1, Length 2,401 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1-208ENST00000519004 CCNJLQ8IV13 435 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 BAP1Q92560 729 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 NUDCD1Q96RS6 583 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 AP1M1Q9BXS5 423 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 TRIM7Q9C029 511 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 FAM192AQ9GZU8 254 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 CACNA2D1P54289 1103 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 TCIRG1Q13488 830 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 IL17AQ16552 155 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 RTN1Q16799 776 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 HGSNATQ68CP4 663 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 FAM13CQ8NE31 585 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 RMI1Q9H9A7 625 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 NMRK1Q9NWW6 199 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 LRCH1Q9Y2L9 728 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 GMEB1Q9Y692 573 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 LMO7Q8WWI1 1683 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 LRP6O75581 1613 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 KCNK3O14649 394 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 MGAT5Q09328 741 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 PTGDRQ13258 359 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 MUM1Q2TAK8 710 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 ACTRT1Q8TDG2 376 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 AMACRQ9UHK6 382 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 MROH7Q68CQ1 1323 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 RASA1P20936 1047 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 BPIFB4P59827 614 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 CNPY1Q3B7I2 92 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 ATP8B4Q8TF62 1192 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 TAF4BQ92750 862 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 LRMDAQ9H2I8 198 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 VCX3BQ9H321 246 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 VCX3AQ9NNX9 186 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 TMEM94Q12767 1356 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 TCP11X1B4DZS4 312 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 NVLO15381 856 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 AGTP01019 485 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 AFPP02771 609 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 FAM200BP0CF97 657 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 DESP17661 470 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 KCNA3P22001 575 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 RXRBP28702 533 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 LMNB2Q03252 620 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 MCL1Q07820 350 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 RCN2Q14257 317 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 Q4G0T1 1027 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 PDXDC1Q6P996 788 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 TTC8Q8TAM2 541 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 DPH5Q9H2P9 285 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 FAM114A2Q9NRY5 505 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 ABCF2Q9UG63 623 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 TLDC2A0PJX2 215 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 H0Y3Z8 333 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 TTI1O43156 1089 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 CEP104O60308 925 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 KRT2P35908 639 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 CASP7P55210 303 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 USP46P62068 366 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 TTC38Q5R3I4 469 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 MKL1Q969V6 931 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 SMIM23A6NLE4 172 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 CCDC169A6NNP5 214 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 RHOBTB3O94955 611 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 TJP3O95049 919 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 SPATA31D3P0C874 917 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 ITGA4P13612 1032 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 CCNE1P24864 410 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 DEUP1Q05D60 604 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 RPS6KA1Q15418 735 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 GATA6Q92908 595 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 P2RX5Q93086 422 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 GBP5Q96PP8 586 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-208ENST00000519004 FMO2Q99518 471 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms