RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506464.5

ABCC3-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, human

TSL 4

Gene ABCC3, Length 540 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC3-208	ENST00000506464	DEFB103A	P81534	67 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	ADGRE1	Q14246	886 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	GRIK4	Q16099	956 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	SAMD11	Q96NU1	681 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	THEG	Q9P2T0	379 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	MYO9B	Q13459	2157 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	STAT5B	P51692	787 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	NTRK3	Q16288	839 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	PKN1	Q16512	942 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	IER5	Q5VY09	327 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	USP38	Q8NB14	1042 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464		M0QZ92	97 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	CTSH	P09668	335 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	AR	P10275	920 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	MARK3	P27448	753 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	CIITA	P33076	1130 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	ERVK-21	P61565	698 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	AAK1	Q2M2I8	961 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	NME8	Q8N427	588 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	PGBD1	Q96JS3	809 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	TMEM260	Q9NX78	707 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	TRPC6	Q9Y210	931 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	COL1A2	P08123	1366 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM86B1	E9PN63	330 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	CPLX1	O14810	134 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	HBP1	O60381	514 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	DEXI	O95424	95 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	INSRR	P14616	1297 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	KRT76	Q01546	638 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	MGAT3	Q09327	533 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	GALNT17	Q6IS24	598 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	PPM1E	Q8WY54	764 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	PHKB	Q93100	1093 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	TOP1MT	Q969P6	601 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	PCYT2	Q99447	389 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	SI	P14410	1827 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	EYS	Q5T1H1	3165 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464		A0A0C4DFX4	3053 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	POTEB3	A0JP26	581 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	LINC01553	A4QN01	128 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	CDKL5	O76039	1030 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	USP11	P51784	963 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	AK2	P54819	239 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	PLCB4	Q15147	1175 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	TCTN1	Q2MV58	587 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	ODR4	Q5SWX8	454 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	POTEB	Q6S5H4	581 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	13.88	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	IL27	Q8NEV9	243 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	YME1L1	Q96TA2	773 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	COG5	Q9UP83	839 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	TRANK1	O15050	2925 aa		13.88	□□□□□ -0.19

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