RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 HRH3Q9Y5N1 445 aa11.02□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 FRMPD4Q14CM0 1322 aa11.02□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 LAD1O00515 517 aa11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 NEMFO60524 1076 aa11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 LGR5O75473 907 aa11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 YEATS4O95619 227 aa11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 WEE1P30291 646 aa11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 PTGIRP43119 386 aa11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 ARHGAP4P98171 946 aa11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 CLN3Q13286 438 aa11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 INF2Q27J81 1249 aa11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 LETM2Q2VYF4 491 aa11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 ARHGEF16Q5VV41 709 aa11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 XRRA1Q6P2D8 792 aa11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 TBCKQ8TEA7 893 aa11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM260Q9NX78 707 aa11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 SERTAD1Q9UHV2 236 aa11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 LRRC37A2A6NM11 1700 aa11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 A0A1W2PRU2 124 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 FIBPO43427 364 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 STAM2O75886 525 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 CCND2P30279 289 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF76P36508 570 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 USP11P51784 963 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 FCGRTP55899 365 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 ARHGEF6Q15052 776 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 STK38Q15208 465 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 MTFR1Q15390 333 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 GNPTABQ3T906 1256 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 ANO1Q5XXA6 986 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 C17orf99Q6UX52 265 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 GPR142Q7Z601 462 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 PLEKHH3Q7Z736 793 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 TNS4Q8IZW8 715 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 C1orf216Q8TAB5 229 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 SPATA32Q96LK8 384 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 PRIMPOLQ96LW4 560 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 RMDN3Q96TC7 470 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 PORCNQ9H237 461 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 PXMP2Q9NR77 195 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 RPTORQ8N122 1335 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 MGAMO43451 1857 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 MYH7BA7E2Y1 1941 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 SLC15A5A6NIM6 579 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 BAG4O95429 457 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 NASPP49321 788 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 RELBQ01201 579 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 GRB14Q14449 540 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 PCNX4Q63HM2 1172 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 PPP4R3AQ6IN85 833 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 CLEC17AQ6ZS10 378 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 CDHR1Q96JP9 859 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 PGBD1Q96JS3 809 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 IWS1Q96ST2 819 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 ZIC5Q96T25 663 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 RAB34Q9BZG1 259 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 EFCC1Q9HA90 598 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 RTEL1Q9NZ71 1219 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 ELP1O95163 1332 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 LCTP09848 1927 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 SMCHD1A6NHR9 2005 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 ASB14A6NK59 587 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 MARCH6O60337 910 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 AVPP01185 164 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 CYP3A4P08684 503 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 ATP2B1P20020 1258 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 ADORA2AP29274 412 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 MCM7P33993 719 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 SMTNP53814 917 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 HTRA3P83110 453 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 FOXK2Q01167 660 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 PGM5Q15124 567 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM266Q2M3C6 531 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 DPP9Q86TI2 863 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 USP28Q96RU2 1077 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 PDCD2LQ9BRP1 358 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-211ENST00000497210 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms