RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494468.1

XPO1-223, Transcript of exportin 1, human

TSL 3

Gene XPO1, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
XPO1-223	ENST00000494468	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	IL2	P60568	153 aa		4.55	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	OCRL	Q01968	901 aa		4.55	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		4.55	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	ZNF174	Q15697	407 aa		4.55	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.55	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		4.55	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		4.55	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		4.55	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	NXPE1	Q8N323	547 aa		4.55	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		4.55	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	USP7	Q93009	1102 aa		4.55	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		4.55	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	RFXAP	O00287	272 aa		4.54	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	TSPAN15	O95858	294 aa		4.54	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	LRG1	P02750	347 aa		4.54	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	LIMS1	P48059	325 aa		4.54	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	KIF11	P52732	1056 aa		4.54	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	HERVK_113	P62684	666 aa		4.54	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	STRN3	Q13033	797 aa		4.54	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	SEC23A	Q15436	765 aa		4.54	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	CD276	Q5ZPR3	534 aa		4.54	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	VASN	Q6EMK4	673 aa		4.54	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	C11orf74	Q86VG3	221 aa		4.54	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	PASD1	Q8IV76	773 aa		4.54	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.54	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		4.54	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	DLG3	Q92796	817 aa		4.54	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	TTC1	Q99614	292 aa		4.54	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	ACSS2	Q9NR19	701 aa		4.54	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	OXSM	Q9NWU1	459 aa		4.54	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	FOXP2	O15409	715 aa		4.53	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	CYP17A1	P05093	508 aa		4.53	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	C1QTNF9	P0C862	333 aa		4.53	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	LSS	P48449	732 aa		4.53	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	FOXO4	P98177	505 aa		4.53	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	NFKB2	Q00653	900 aa		4.53	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	PTPRO	Q16827	1216 aa		4.53	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		4.53	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		4.53	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		4.53	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	EFHB	Q8N7U6	833 aa		4.53	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	SCYL1	Q96KG9	808 aa		4.53	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	TMEM209	Q96SK2	561 aa		4.53	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		4.53	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.53	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		4.53	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	MCM8	Q9UJA3	840 aa		4.53	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		4.53	□□□□□ -1.68
XPO1-223	ENST00000494468	ZNF839	A8K0R7	811 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	NEMP1	O14524	444 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	ZEB2	O60315	1214 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	BRINP1	O60477	761 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	FKBP9	O95302	570 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	MME	P08473	750 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	BPI	P17213	487 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	PI3	P19957	117 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	SDHA	P31040	664 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	FNTB	P49356	437 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	SSPN	Q14714	243 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	LIPI	Q6XZB0	460 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	FAM129C	Q86XR2	697 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	TTLL6	Q8N841	843 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	CLIC6	Q96NY7	704 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	GBP4	Q96PP9	640 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	WRNIP1	Q96S55	665 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	CD320	Q9NPF0	282 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	TOMM22	Q9NS69	142 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		4.52	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	DVL2	O14641	736 aa		4.51	□□□□□ -1.69
XPO1-223	ENST00000494468	KRT1	P04264	644 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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