RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 CHMP2AO43633 222 aa22.12■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 KRT9P35527 623 aa22.12■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 ETF1P62495 437 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.12■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 TPH2Q8IWU9 490 aa22.12■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.12■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 KCND2Q9NZV8 630 aa22.12■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 WDR81Q562E7 1941 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 MYH11P35749 1972 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 HOXD13P35453 343 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 MTF1Q14872 753 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 SYCP1Q15431 976 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 KIF18AQ8NI77 898 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 NDST4Q9H3R1 872 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 RNF181Q9P0P0 153 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 SIK3Q9Y2K2 1263 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 ADGRG1Q9Y653 693 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 A0A1W2PQJ5 194 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 GNA14O95837 355 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 CASP5P51878 434 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 ZNF131P52739 623 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 ERVK-24P63145 666 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 MAP3K9P80192 1104 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 OR8K1Q8NGG5 319 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 RMDN3Q96TC7 470 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 RSPH10BP0C881 870 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 FKBP15Q5T1M5 1219 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 LXNQ9BS40 222 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 SYT17Q9BSW7 474 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.09■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 LYPLA2O95372 231 aa22.09■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.133e-7■■■□□ 19.1
NELFE-211ENST00000492185 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 MTMR1Q13613 665 aa22.09■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 VGLL4Q14135 290 aa22.09■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 MEA1Q16626 185 aa22.09■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 TRAF5O00463 557 aa22.08■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 CCDC175P0C221 793 aa22.08■■□□□ 1.13
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NELFE-211ENST00000492185 MIER3Q7Z3K6 550 aa22.08■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.08■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.08■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.08■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.08■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 ODF2LQ9ULJ1 636 aa22.08■■□□□ 1.13
NELFE-211ENST00000492185 PDXKO00764 312 aa22.07■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 ZBTB39O15060 712 aa22.07■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 GUCY2CP25092 1073 aa22.07■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 NSMFQ6X4W1 530 aa22.07■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.07■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.07■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 DESI2Q9BSY9 194 aa22.07■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 P4HBP07237 508 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 KLK7P49862 253 aa22.07■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 ZBED6P86452 979 aa22.07■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 WDR59Q6PJI9 974 aa22.07■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 FIZ1Q96SL8 496 aa22.07■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.07■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 L2HGDHQ9H9P8 463 aa22.07■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 MYBP10242 640 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 SYT10Q6XYQ8 523 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 ZNF592Q92610 1267 aa22.06■■□□□ 1.12
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NELFE-211ENST00000492185 FANCGO15287 622 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 FAM13AO94988 1023 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 CCND2P30279 289 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 CDK17Q00537 523 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 SULF1Q8IWU6 871 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 BANK1Q8NDB2 785 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NELFE-211ENST00000492185 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
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