RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491037.1

GAPDHP22-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 22, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP22, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP22-201ENST00000491037 GAS7O60861 476 aa9.63□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 PSMD10O75832 226 aa9.63□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 SFNP31947 248 aa9.63□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 CYP2C18P33260 490 aa9.63□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 JAK3P52333 1124 aa9.63□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 PPFIA1Q13136 1202 aa9.63□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 LETM2Q2VYF4 491 aa9.63□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 LRCH2Q5VUJ6 765 aa9.63□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 FAM160B1Q5W0V3 765 aa9.63□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa9.63□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 TAF2Q6P1X5 1199 aa9.63□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 RPAINQ86UA6 219 aa9.63□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 LMBR1Q8WVP7 490 aa9.63□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 GLG1Q92896 1179 aa9.63□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 FAM20AQ96MK3 541 aa9.63□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 TEKT3Q9BXF9 490 aa9.63□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 RNPEPQ9H4A4 650 aa9.63□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 IL23AQ9NPF7 189 aa9.63□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 KAT6AQ92794 2004 aa9.63□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 RRN3P2A6NIE6 340 aa9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 BTBD18B2RXH4 712 aa9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 SLC37A4O43826 429 aa9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 DTNBO60941 627 aa9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 PSAPP07602 524 aa9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 IQCF3P0C7M6 154 aa9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 CSF2RAP15509 400 aa9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 SELPP16109 830 aa9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 TRAPPC10P48553 1259 aa9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 STAT5BP51692 787 aa9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 CHMP4BP1P59074 171 aa9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 PPP2R5CQ13362 524 aa9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 CUL4AQ13619 759 aa9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 HIC1Q14526 733 aa9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 GRIK4Q16099 956 aa9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 RASIP1Q5U651 963 aa9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 GPR153Q6NV75 609 aa9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 LRRC8DQ7L1W4 858 aa9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 SLFN12Q8IYM2 578 aa9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 RETREG2Q8NC44 543 aa9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 ATP8B4Q8TF62 1192 aa9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 ATP6V0A1Q93050 837 aa9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 FAM167AQ96KS9 214 aa9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 ZNF302Q9NR11 478 aa9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 TUBE1Q9UJT0 475 aa9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 SCN5AQ14524 2016 aa9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 SIP14410 1827 aa9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 FAM205CA6NFA0 338 aa9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 BACH1O14867 736 aa9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 TREHO43280 583 aa9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 HBP1O60381 514 aa9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 NEMFO60524 1076 aa9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 CXCL10P02778 98 aa9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 CKBP12277 381 aa9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 MARK3P27448 753 aa9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 EPHB4P54760 987 aa9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 CCL23P55773 120 aa9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 PLCB4Q15147 1175 aa9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 TMEM240Q5SV17 173 aa9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 C9orf50Q5SZB4 431 aa9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 TRAF7Q6Q0C0 670 aa9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 NOSTRINQ8IVI9 506 aa9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 WNT8BQ93098 351 aa9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 VWCEQ96DN2 955 aa9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 UNC45AQ9H3U1 944 aa9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 DISC1Q9NRI5 854 aa9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 SETD4Q9NVD3 440 aa9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 PCDH10Q9P2E7 1040 aa9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 VAV3Q9UKW4 847 aa9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 TRPC6Q9Y210 931 aa9.61□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 POTEB3A0JP26 581 aa9.6□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 BAIAP3O94812 1187 aa9.6□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 INSRRP14616 1297 aa9.6□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 GJB2P29033 226 aa9.6□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 GUCY1B3Q02153 619 aa9.6□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 SHHQ15465 462 aa9.6□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 MARCH8Q5T0T0 291 aa9.6□□□□□ -0.87
GAPDHP22-201ENST00000491037 POTEBQ6S5H4 581 aa9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms