RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489352.5

HDAC6-233, Transcript of histone deacetylase 6, human

TSL 4

Gene HDAC6, Length 585 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC6-233	ENST00000489352	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC6-233	ENST00000489352	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
HDAC6-233	ENST00000489352	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC6-233	ENST00000489352	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC6-233	ENST00000489352	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		13.52	□□□□□ -0.24
HDAC6-233	ENST00000489352	TSPY2	A6NKD2	308 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	SPTLC1	O15269	473 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	EOMES	O95936	686 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	CHRNA1	P02708	482 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	CFH	P08603	1231 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	CA8	P35219	290 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	LPIN1	Q14693	890 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	TMC7	Q7Z402	723 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	RGS22	Q8NE09	1264 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	WNT16	Q9UBV4	365 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	MYH6	P13533	1939 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	FSCN2	O14926	492 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	GGPS1	O95749	300 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	CHGB	P05060	677 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	APOBR	Q0VD83	1088 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	13.51	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	GPR20	Q99678	358 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	KCNK12	Q9HB15	430 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	CA14	Q9ULX7	337 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	HIDE1	A8MVS5	230 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	SCG2	P13521	617 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	HOXC8	P31273	242 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	KRT17	Q04695	432 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	USP26	Q9BXU7	913 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	LZTS1	Q9Y250	596 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	LGALS2	P05162	132 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	NR3C2	P08235	984 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	GNAT2	P19087	354 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	NETO1	Q8TDF5	533 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	MAF1	Q9H063	256 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	FRY	Q5TBA9	3013 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	LAMTOR5	O43504	91 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	PROS1	P07225	676 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	TRIM27	P14373	513 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	CD52	P31358	61 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	GATM	P50440	423 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	NRCAM	Q92823	1304 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	KRBA1	A5PL33	1030 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	SLC30A4	O14863	429 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDAC6-233	ENST00000489352	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25

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