RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 IRF9Q00978 393 aa6.39□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 VWA3BQ502W6 1294 aa6.39□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.39□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 CD276Q5ZPR3 534 aa6.39□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.39□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 ORAI3Q9BRQ5 295 aa6.39□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 TMX1Q9H3N1 280 aa6.39□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.39□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.39□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 FFAR3O14843 346 aa6.38□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 ADAM9Q13443 819 aa6.38□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.38□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 LIPIQ6XZB0 460 aa6.38□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 STK32CQ86UX6 486 aa6.38□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 PROSER1Q86XN7 944 aa6.38□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 DTX3Q8N9I9 347 aa6.38□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.38□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.38□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.38□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa6.38□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.37□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 ZNF839A8K0R7 811 aa6.37□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 H7C1D1 291 aa6.37□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 TRAF5O00463 557 aa6.37□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 KPNA6O60684 536 aa6.37□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 KRT37O76014 449 aa6.37□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 FBXO21O94952 628 aa6.37□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 PFKPQ01813 784 aa6.37□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.37□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 CPZQ66K79 652 aa6.37□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 SP8Q8IXZ3 490 aa6.37□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 DLG3Q92796 817 aa6.37□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 SYT3Q9BQG1 590 aa6.37□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 FOXP2O15409 715 aa6.36□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 GAS7O60861 476 aa6.36□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 CHGBP05060 677 aa6.36□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 ZNF174Q15697 407 aa6.36□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.36□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 CARFQ8N187 725 aa6.36□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.36□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.36□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 ACSS2Q9NR19 701 aa6.36□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.36□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.36□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 CROTQ9UKG9 612 aa6.36□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.36□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 PDE8AO60658 829 aa6.35□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 PTGS1P23219 599 aa6.35□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 AOAHP28039 575 aa6.35□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 SDHAP31040 664 aa6.35□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.35□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 SEC23AQ15436 765 aa6.35□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 VMACQ2NL98 169 aa6.35□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 PRR31Q5SQ13 230 aa6.35□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.35□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 MTFR1LQ9H019 292 aa6.35□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.35□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 IFT57Q9NWB7 429 aa6.35□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 WASF3Q9UPY6 502 aa6.35□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 A0A087X0B3 334 aa6.34□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 GSG1L2A8MUP6 293 aa6.34□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 F2P00734 622 aa6.34□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 CYP17A1P05093 508 aa6.34□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 MMEP08473 750 aa6.34□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 KCNC1P48547 511 aa6.34□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 SCNN1BP51168 640 aa6.34□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 KIF11P52732 1056 aa6.34□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 SLURP1P55000 103 aa6.34□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 FAM26FQ5R3K3 315 aa6.34□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.34□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.34□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 HIPK4Q8NE63 616 aa6.34□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.34□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 E2F7Q96AV8 911 aa6.34□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.34□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.34□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 PRKAB1Q9Y478 270 aa6.34□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 ASB1Q9Y576 335 aa6.34□□□□□ -1.39
PTEN-204ENST00000487939 FAM83GA6ND36 823 aa6.33□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 SASH1O94885 1247 aa6.33□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 ZNF28P17035 718 aa6.33□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 IL13P35225 146 aa6.33□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 SOX5P35711 763 aa6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms