RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482651.5

HDGF-208, Transcript of heparin binding growth factor, human

TSL 3

Gene HDGF, Length 966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDGF-208	ENST00000482651	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	NOD1	Q9Y239	953 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	HAS3	O00219	553 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	SORBS3	O60504	671 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	PPFIA4	O75335	1185 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	FGB	P02675	491 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	PFKM	P08237	780 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	ZNF286B	P0CG31	522 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	CPA1	P15085	419 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	DDIT3	P35638	169 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	GCGR	P47871	477 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	CHMP4BP1	P59074	171 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	BFSP2	Q13515	415 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	NEDD9	Q14511	834 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	PTGIS	Q16647	500 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	UBE2S	Q16763	222 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	NLRX1	Q86UT6	975 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	HERVK_113	Q902F9	699 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	BRF1	Q92994	677 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	SCLY	Q96I15	445 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	SKI	P12755	728 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	CDC27	P30260	824 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	RFC2	P35250	354 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	10	□□□□□ -0.81	3e-15	■□□□□ 8.9
HDGF-208	ENST00000482651	NAPA	P54920	295 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	APOBR	Q0VD83	1088 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	METTL7B	Q6UX53	244 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	C7orf31	Q8N865	590 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	CAGE1	Q8TC20	777 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	GPRASP2	Q96D09	838 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	VWCE	Q96DN2	955 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	CDHR1	Q96JP9	859 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	GUCD1	Q96NT3	240 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	ALG1	Q9BT22	464 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	NID2	Q14112	1375 aa		10	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	STXBP3	O00186	592 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	CPLX1	O14810	134 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	CDKL5	O76039	1030 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	IQCF3	P0C7M6	154 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	COL9A1	P20849	921 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	ADCY7	P51828	1080 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	RBL2	Q08999	1139 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	PTK7	Q13308	1070 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	FAM161B	Q96MY7	647 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	GPR20	Q99678	358 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	BARHL2	Q9NY43	387 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	SMCO2	A6NFE2	343 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651		H3BRB1	525 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
HDGF-208	ENST00000482651	LGALS2	P05162	132 aa		9.98	□□□□□ -0.81

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