RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474214.2

RUBCN-210, Transcript of RUN and cysteine rich domain containing beclin 1 interacting protein, humanhuman

TSL 5

Gene RUBCN, Length 615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCN-210ENST00000474214 CTSHP09668 335 aa25.2■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 MARK3P27448 753 aa25.2■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 PPFIA1Q13136 1202 aa25.2■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 GRIK4Q16099 956 aa25.2■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 MCTP2Q6DN12 878 aa25.2■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 SPRED2Q7Z698 418 aa25.2■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 GLG1Q92896 1179 aa25.2■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 C6orf50Q9HD87 102 aa25.2■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa25.2■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 EDIL3O43854 480 aa25.19■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 CCNE2O96020 404 aa25.19■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 CHRNA1P02708 482 aa25.19■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 CCT2P78371 535 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 MGAT3Q09327 533 aa25.19■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 TAF2Q6P1X5 1199 aa25.19■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa25.19■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 SDF4Q9BRK5 362 aa25.19■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 WDR81Q562E7 1941 aa25.18■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 PPFIA3O75145 1194 aa25.18■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 RAD9AQ99638 391 aa25.18■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 SLC26A6Q9BXS9 759 aa25.18■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 TUBE1Q9UJT0 475 aa25.18■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 RFXAPO00287 272 aa25.17■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 INSRRP14616 1297 aa25.17■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 IGFBP4P22692 258 aa25.17■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 GNA11P29992 359 aa25.17■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 CIITAP33076 1130 aa25.17■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 PLCB4Q15147 1175 aa25.17■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 ABHD15Q6UXT9 468 aa25.17■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 PLA2G4DQ86XP0 818 aa25.17■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 CERS4Q9HA82 394 aa25.17■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 PRDM6Q9NQX0 595 aa25.17■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 SH3GLB2Q9NR46 395 aa25.17■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 RRN3P2A6NIE6 340 aa25.16■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 ZNF76P36508 570 aa25.16■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 SEPT8Q92599 483 aa25.16■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 LENG9Q96B70 501 aa25.16■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 VPS54Q9P1Q0 977 aa25.16■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa25.16■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 LPXNO60711 386 aa25.15■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 STAT5BP51692 787 aa25.15■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 BICD2Q8TD16 824 aa25.15■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 RASGRP4Q8TDF6 673 aa25.15■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 ZBTB10Q96DT7 871 aa25.15■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 ZBED2Q9BTP6 218 aa25.15■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 AZI2Q9H6S1 392 aa25.15■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 MTCH2Q9Y6C9 303 aa25.15■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 LINC01553A4QN01 128 aa25.14■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 SLC26A2P50443 739 aa25.14■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 CCDC148Q8NFR7 591 aa25.14■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 DNAJB3Q8WWF6 145 aa25.14■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 ARNTL2Q8WYA1 636 aa25.14■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
RUBCN-210ENST00000474214 COL4A6Q14031 1691 aa25.13■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 AMHP03971 560 aa25.13■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 LPIN1Q14693 890 aa25.13■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 PPM1EQ8WY54 764 aa25.13■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 APBB2Q92870 758 aa25.13■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 TOP1MTQ969P6 601 aa25.13■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 IL17RAQ96F46 866 aa25.13■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 NCOR1O75376 2440 aa25.13■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 M0R2N6 131 aa25.12■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 ERVK-21P61565 698 aa25.12■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 SETQ01105 290 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 NPY5RQ15761 445 aa25.12■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 FBXO47Q5MNV8 452 aa25.12■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa25.12■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 TBC1D22BQ9NU19 505 aa25.12■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 PDRG1Q9NUG6 133 aa25.12■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 INSL6Q9Y581 213 aa25.12■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa25.12■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 BDP1A6H8Y1 2624 aa25.12■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 POTEB3A0JP26 581 aa25.11■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 ATP4AP20648 1035 aa25.11■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 IGBP1P78318 339 aa25.11■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 GRB10Q13322 594 aa25.11■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 FAM117BQ6P1L5 589 aa25.11■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 POTEBQ6S5H4 581 aa25.11■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 RSPH3Q86UC2 560 aa25.11■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 MYOCDQ8IZQ8 938 aa25.11■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 ZNF577Q9BSK1 485 aa25.11■■□□□ 1.61
RUBCN-210ENST00000474214 TRPC6Q9Y210 931 aa25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms