RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472880.1

COL9A3-210, Transcript of collagen type IX alpha 3 chain, humanhuman

TSL 3

Gene COL9A3, Length 959 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3-210ENST00000472880 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
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COL9A3-210ENST00000472880 FUT2Q10981 343 aa22.57■■□□□ 1.2
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COL9A3-210ENST00000472880 SMCO2A6NFE2 343 aa22.56■■□□□ 1.2
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COL9A3-210ENST00000472880 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.55■■□□□ 1.2
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COL9A3-210ENST00000472880 ARP10275 920 aa22.54■■□□□ 1.2
COL9A3-210ENST00000472880 INSRRP14616 1297 aa22.54■■□□□ 1.2
COL9A3-210ENST00000472880 CDC27P30260 824 aa22.54■■□□□ 1.2
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COL9A3-210ENST00000472880 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
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COL9A3-210ENST00000472880 TMEM260Q9NX78 707 aa22.54■■□□□ 1.2
COL9A3-210ENST00000472880 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.54■■□□□ 1.2
COL9A3-210ENST00000472880 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.53■■□□□ 1.2
COL9A3-210ENST00000472880 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
COL9A3-210ENST00000472880 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.53■■□□□ 1.2
COL9A3-210ENST00000472880 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.53■■□□□ 1.2
COL9A3-210ENST00000472880 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.53■■□□□ 1.2
COL9A3-210ENST00000472880 TMEM192Q8IY95 271 aa22.53■■□□□ 1.2
COL9A3-210ENST00000472880 IL17RAQ96F46 866 aa22.53■■□□□ 1.2
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COL9A3-210ENST00000472880 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
COL9A3-210ENST00000472880 M0QZ92 97 aa22.52■■□□□ 1.2
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COL9A3-210ENST00000472880 STAT5BP51692 787 aa22.52■■□□□ 1.2
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COL9A3-210ENST00000472880 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa22.52■■□□□ 1.2
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COL9A3-210ENST00000472880 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.52■■□□□ 1.2
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COL9A3-210ENST00000472880 SCG2P13521 617 aa22.5■■□□□ 1.19
COL9A3-210ENST00000472880 CPA1P15085 419 aa22.5■■□□□ 1.19
COL9A3-210ENST00000472880 CTNNB1P35222 781 aa22.5■■□□□ 1.19
COL9A3-210ENST00000472880 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
COL9A3-210ENST00000472880 SLC26A2P50443 739 aa22.5■■□□□ 1.19
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COL9A3-210ENST00000472880 Q6ZUG5 572 aa22.5■■□□□ 1.19
COL9A3-210ENST00000472880 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
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COL9A3-210ENST00000472880 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.5■■□□□ 1.19
COL9A3-210ENST00000472880 POTEB3A0JP26 581 aa22.49■■□□□ 1.19
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COL9A3-210ENST00000472880 KCNA5P22460 613 aa22.49■■□□□ 1.19
COL9A3-210ENST00000472880 CD52P31358 61 aa22.49■■□□□ 1.19
COL9A3-210ENST00000472880 FAM160B1Q5W0V3 765 aa22.49■■□□□ 1.19
COL9A3-210ENST00000472880 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.49■■□□□ 1.19
COL9A3-210ENST00000472880 POTEBQ6S5H4 581 aa22.49■■□□□ 1.19
COL9A3-210ENST00000472880 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.49■■□□□ 1.19
COL9A3-210ENST00000472880 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.49■■□□□ 1.19
COL9A3-210ENST00000472880 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.49■■□□□ 1.19
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COL9A3-210ENST00000472880 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
COL9A3-210ENST00000472880 ESYT2A0FGR8 921 aa22.48■■□□□ 1.19
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COL9A3-210ENST00000472880 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.48■■□□□ 1.19
COL9A3-210ENST00000472880 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.48■■□□□ 1.19
COL9A3-210ENST00000472880 MCTP2Q6DN12 878 aa22.48■■□□□ 1.19
COL9A3-210ENST00000472880 BANK1Q8NDB2 785 aa22.48■■□□□ 1.19
COL9A3-210ENST00000472880 KCNB2Q92953 911 aa22.48■■□□□ 1.19
COL9A3-210ENST00000472880 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.48■■□□□ 1.19
COL9A3-210ENST00000472880 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.48■■□□□ 1.19
COL9A3-210ENST00000472880 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
COL9A3-210ENST00000472880 C6orf50Q9HD87 102 aa22.48■■□□□ 1.19
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