RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469694.5

GPC1-208, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 2,862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-208ENST00000469694 KCNJ18B7U540 433 aa15.27■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 CLK2P49760 499 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 KCNJ12Q14500 433 aa15.27■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 CALCRLQ16602 461 aa15.27■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa15.27■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 RRAGBQ5VZM2 374 aa15.27■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 KCTD16Q68DU8 428 aa15.27■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 CCDC125Q86Z20 511 aa15.27■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 ZIM3Q96PE6 472 aa15.27■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 RWDD2AQ9UIY3 292 aa15.27■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 PSME4Q14997 1843 aa15.27■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 PLCG1P19174 1290 aa15.27■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 PTGER2P43116 358 aa15.27■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 CRYMQ14894 314 aa15.27■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 SYDE2Q5VT97 1194 aa15.27■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 MICALL2Q8IY33 904 aa15.27■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 GMCL1Q96IK5 515 aa15.27■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 GUCY1A3Q02108 690 aa15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 DRP2Q13474 957 aa15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 PTGISQ16647 500 aa15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 C6orf89Q6UWU4 347 aa15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 CABP7Q86V35 215 aa15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 CCT8L2Q96SF2 557 aa15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 FBXO28Q9NVF7 368 aa15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 PGAP2Q9UHJ9 254 aa15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 PRR12Q9ULL5 1215 aa15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 GDAQ9Y2T3 454 aa15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 PPP1R37O75864 691 aa15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 CDR1P51861 262 aa15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 SPATA4Q8NEY3 305 aa15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 MTMR9Q96QG7 549 aa15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 NUDT12Q9BQG2 462 aa15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 VPS33BQ9H267 617 aa15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 CENPHQ9H3R5 247 aa15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 CAPN11Q9UMQ6 739 aa15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 SNX12Q9UMY4 172 aa15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 MEIS2O14770 477 aa15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 KRT14P02533 472 aa15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 ERCC3P19447 782 aa15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 PRPHP41219 470 aa15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 SLC7A5Q01650 507 aa15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 IFT88Q13099 833 aa15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 DUSP10Q9Y6W6 482 aa15.26■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 LAD1O00515 517 aa15.25■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 PES1O00541 588 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 PAX7P23759 505 aa15.25■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 CCDC174Q6PII3 467 aa15.25■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 NLRP14Q86W24 1093 aa15.25■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 IQCKQ8N0W5 287 aa15.25■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 MTMR14Q8NCE2 650 aa15.25■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 MAGEC3Q8TD91 643 aa15.25■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 AMNQ9BXJ7 453 aa15.25■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa15.25■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 TRIM49BA6NDI0 452 aa15.25■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 TNFRSF8P28908 595 aa15.25■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 CAP2P40123 477 aa15.25■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 SNCBQ16143 134 aa15.25■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 MEA1Q16626 185 aa15.25■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 PPP1R18Q6NYC8 613 aa15.25■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 FBXO11Q86XK2 927 aa15.25■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 MB21D1Q8N884 522 aa15.25■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 TBC1D5Q92609 795 aa15.25■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 STIM2Q9P246 746 aa15.25■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 TMX2Q9Y320 296 aa15.25■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 SMCHD1A6NHR9 2005 aa15.25■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 ZNF541Q9H0D2 1346 aa15.24■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 OPLAHO14841 1288 aa15.24■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 FAM107AO95990 144 aa15.24■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 SEC24CP53992 1094 aa15.24■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 PAK1Q13153 545 aa15.24■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 TNIP1Q15025 636 aa15.24■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 FAM83AQ86UY5 434 aa15.24■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 FAM228AQ86W67 206 aa15.24■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 PARP9Q8IXQ6 854 aa15.24■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 HAS1Q92839 578 aa15.24■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 CCSER1Q9C0I3 900 aa15.24■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 A0A1W2PQC6 194 aa15.24■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 NEBLO76041 1014 aa15.24■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 RPN1P04843 607 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 PRLRP16471 622 aa15.24■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 STAT2P52630 851 aa15.24■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 CEP57Q86XR8 500 aa15.24■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 CCDC50Q8IVM0 306 aa15.24■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 POLD4Q9HCU8 107 aa15.24■□□□□ 0.03
GPC1-208ENST00000469694 LRWD1Q9UFC0 647 aa15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms