RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466278.1

MKL1-208, Transcript of MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene MKL1, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1-208ENST00000466278 TUBE1Q9UJT0 475 aa25.93■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa25.93■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 NLRP5P59047 1200 aa25.92■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 TCTN1Q2MV58 587 aa25.92■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa25.92■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 RPAINQ86UA6 219 aa25.92■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 UNC80Q8N2C7 3258 aa25.92■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 A0A0C4DFX4 3053 aa25.91■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 RRN3P2A6NIE6 340 aa25.91■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 DEFB103AP81534 67 aa25.91■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa25.91■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 TRPC6Q9Y210 931 aa25.91■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 TLL1O43897 1013 aa25.9■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 CDKL5O76039 1030 aa25.9■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 ATG7O95352 703 aa25.9■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 CIITAP33076 1130 aa25.9■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 SLC26A2P50443 739 aa25.9■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 STAT5BP51692 787 aa25.9■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 FAM26DQ5JW98 314 aa25.9■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 RSPH3Q86UC2 560 aa25.9■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 DBF4BQ8NFT6 615 aa25.9■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 SEPT8Q92599 483 aa25.9■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 ZNF577Q9BSK1 485 aa25.9■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 CCNE2O96020 404 aa25.89■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 INSRRP14616 1297 aa25.89■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 IGBP1P78318 339 aa25.89■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 ANKRD1Q15327 319 aa25.89■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 PRR16Q569H4 304 aa25.89■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 RUFY4Q6ZNE9 571 aa25.89■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP25.89■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 ZBED2Q9BTP6 218 aa25.89■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.89■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 TBC1D22BQ9NU19 505 aa25.89■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa25.89■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 PCDHA4Q9UN74 947 aa25.89■■□□□ 1.74
MKL1-208ENST00000466278 SIP14410 1827 aa25.88■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa25.88■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 DHX15O43143 795 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 SCRN1Q12765 414 aa25.88■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 PLCB4Q15147 1175 aa25.88■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 FAM160B1Q5W0V3 765 aa25.88■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 ABHD15Q6UXT9 468 aa25.88■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 IL17RAQ96F46 866 aa25.88■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 BACH1O14867 736 aa25.87■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 GJB5O95377 273 aa25.87■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 MARCH8Q5T0T0 291 aa25.87■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 GALNT17Q6IS24 598 aa25.87■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa25.87■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 DAGLBQ8NCG7 672 aa25.87■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 APBB2Q92870 758 aa25.87■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 POTEB3A0JP26 581 aa25.86■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 PFKFB2O60825 505 aa25.86■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 AMHP03971 560 aa25.86■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 USP11P51784 963 aa25.86■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 TAP1Q03518 808 aa25.86■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 ADGRE1Q14246 886 aa25.86■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 POTEBQ6S5H4 581 aa25.86■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 BLIDQ8IZY5 108 aa25.86■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 LENG9Q96B70 501 aa25.86■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.86■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 STK36Q9NRP7 1315 aa25.86■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 CHRNA1P02708 482 aa25.85■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 AK2P54819 239 aa25.85■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 KRT76Q01546 638 aa25.85■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 MGAT3Q09327 533 aa25.85■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 DNAJB3Q8WWF6 145 aa25.85■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 AIFM3Q96NN9 605 aa25.85■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 UIMC1Q96RL1 719 aa25.85■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 RAD9AQ99638 391 aa25.85■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 ZNF302Q9NR11 478 aa25.85■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 TRANK1O15050 2925 aa25.84■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 IGFBP4P22692 258 aa25.84■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 PDXDC2PQ6P474 469 aa25.84■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 MYOCDQ8IZQ8 938 aa25.84■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 TBCKQ8TEA7 893 aa25.84■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 ATP8B4Q8TF62 1192 aa25.84■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 OSBPL7Q9BZF2 842 aa25.84■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 M0R2N6 131 aa25.83■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 HBP1O60381 514 aa25.83■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 ARHGEF15O94989 841 aa25.83■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 NPY5RQ15761 445 aa25.83■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 USP38Q8NB14 1042 aa25.83■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa25.83■■□□□ 1.73
MKL1-208ENST00000466278 COL1A2P08123 1366 aa25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms