RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 PSMC6P62333 389 aa20.14■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 ABCB5Q2M3G0 1257 aa20.14■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 REEP2Q9BRK0 252 aa20.14■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 EHD2Q9NZN4 543 aa20.14■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 AIPL1Q9NZN9 384 aa20.14■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 STIM2Q9P246 746 aa20.14■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa20.14■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 PALMO75781 387 aa20.14■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 SLC7A5Q01650 507 aa20.14■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 NAB2Q15742 525 aa20.14■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.14■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.14■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 SFR1Q86XK3 245 aa20.14■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 FAM20AQ96MK3 541 aa20.14■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 MRIQ9BWK5 157 aa20.14■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa20.14■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 FAM86B1E9PN63 330 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 IVLP07476 585 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 SREBF1P36956 1147 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 STRIP1Q5VSL9 837 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 SYDE2Q5VT97 1194 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 FRMD5Q7Z6J6 570 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 SPAG5Q96R06 1193 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 A0A087X0T9 212 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 FAM228BP0C875 321 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF76P36508 570 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 GMCL1Q96IK5 515 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 GANQ9H2C0 597 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 NDUFB10O96000 172 aa20.12■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 AFPP02771 609 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa20.12■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 KLRC1P26715 233 aa20.12■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 DNA2P51530 1060 aa20.12■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 EPHB4P54760 987 aa20.12■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.12■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 LENG9Q96B70 501 aa20.12■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 FTCDO95954 541 aa20.11■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 CYP4A11Q02928 519 aa20.11■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 MS4A14Q96JA4 679 aa20.11■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 PDXKO00764 312 aa20.11■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 BMP3P12645 472 aa20.11■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.11■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.11■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 MSH4O15457 936 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 RPL13P26373 211 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 TCERG1LQ5VWI1 586 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 EMBQ6PCB8 327 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 PLCB1Q9NQ66 1216 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 AGPSO00116 658 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 GCNT3O95395 438 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 MYBP10242 640 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 ACTN1P12814 892 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 DACT2Q5SW24 774 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 KRT27Q7Z3Y8 459 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 ECE2O60344 883 aa20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 MMP10P09238 476 aa20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 UCHL3P15374 230 aa20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 SLC9A1P19634 815 aa20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 CIITAP33076 1130 aa20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 C10orf76Q5T2E6 689 aa20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 TRERF1Q96PN7 1200 aa20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 PACSIN1Q9BY11 444 aa20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 GOLGA6CA6NDK9 693 aa20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 RPS6KA5O75582 802 aa20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 NPM3O75607 178 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 GH2P01242 217 aa20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 GOLGA6DP0CG33 693 aa20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 PTK2Q05397 1052 aa20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-204ENST00000465425 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.09■□□□□ 0.81
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