RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463022.1

SP110-208, Transcript of SP110 nuclear body protein, human

TSL 2

Gene SP110, Length 405 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SP110-208	ENST00000463022	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	FPGS	Q05932	587 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	SCRN1	Q12765	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	CAGE1	Q8TC20	777 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	BAD	Q92934	168 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	GTF3C6	Q969F1	213 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	GPR20	Q99678	358 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	HIPK3	Q9H422	1215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022		H3BRB1	525 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	ATP9A	O75110	1047 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	CAND2	O75155	1236 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	LGR5	O75473	907 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	GNAT1	P11488	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	ITGB8	P26012	769 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	ZNF76	P36508	570 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	SLC26A2	P50443	739 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	STK3	Q13188	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	PTK7	Q13308	1070 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	BFSP2	Q13515	415 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	RABEP1	Q15276	862 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	NPY5R	Q15761	445 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	PTGIS	Q16647	500 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	ME3	Q16798	604 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	BLID	Q8IZY5	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	C7orf31	Q8N865	590 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	RETREG2	Q8NC44	543 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	WNT2B	Q93097	391 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	KIF2C	Q99661	725 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	SDF4	Q9BRK5	362 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	BACH2	Q9BYV9	841 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	IL23A	Q9NPF7	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	TMEM260	Q9NX78	707 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	NOD1	Q9Y239	953 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	NRCAM	Q92823	1304 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	FAM86B1	E9PN63	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	ATG7	O95352	703 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	CTDNEP1	O95476	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	ZNF286B	P0CG31	522 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	AR	P10275	920 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	CYP2C9	P11712	490 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	CSF2RA	P15509	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SP110-208	ENST00000463022	SELP	P16109	830 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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