RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462063.1

CCDC30-204, Transcript of coiled-coil domain containing 30, human

TSL 3

Gene CCDC30, Length 362 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC30-204	ENST00000462063	MYOT	Q9UBF9	498 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	ARVCF	O00192	962 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	AQP7	O14520	342 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	RASGRP1	O95267	797 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	CRTAM	O95727	393 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	PYGM	P11217	842 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	GNAT1	P11488	350 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	PPP2CB	P62714	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	PPP2CA	P67775	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	GUCY1A3	Q02108	690 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	CHRNA2	Q15822	529 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	PROSER1	Q86XN7	944 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	CBLC	Q9ULV8	474 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC30-204	ENST00000462063	KRIT1	O00522	736 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	B4GALT4	O60513	344 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	ZNF623	O75123	536 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	AMY2A	P04746	511 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	CKM	P06732	381 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	KCNA6	P17658	529 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	AMY2B	P19961	511 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	PAK1	Q13153	545 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	TUSC3	Q13454	348 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	TEPP	Q6URK8	271 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	ALG1	Q9BT22	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	CD244	Q9BZW8	370 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	ACOT7	O00154	380 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	KCNK3	O14649	394 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	WNT9A	O14904	365 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	RAPGEF3	O95398	923 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	ZNF28	P17035	718 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	IL13	P35225	146 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	EPHB4	P54760	987 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	ADAM9	Q13443	819 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	BRAP	Q7Z569	592 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	OSTM1	Q86WC4	334 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	FBXW5	Q969U6	566 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	DSE	Q9UL01	958 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	PATE3	B3GLJ2	98 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	PDE6A	P16499	860 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	DNM2	P50570	870 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	EPHA5	P54756	1037 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	JAM2	P57087	298 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	INHBE	P58166	350 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	NKX3-2	P78367	333 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	PHF19	Q5T6S3	580 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	SLFN13	Q68D06	897 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	KCTD1	Q719H9	257 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063		Q8TCH9	128 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	MBD6	Q96DN6	1003 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	CHFR	Q96EP1	664 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCDC30-204	ENST00000462063	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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