RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445245.5

BRWD1-208, Transcript of bromodomain and WD repeat domain containing 1, human

TSL 1 (best)

Gene BRWD1, Length 1,682 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRWD1-208	ENST00000445245	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	BHMT	Q93088	406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	IFT43	Q96FT9	208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	FGD4	Q96M96	766 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	EHD4	Q9H223	541 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	SEPT3	Q9UH03	358 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	RIPK3	Q9Y572	518 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	ZNF536	O15090	1300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	TECTA	O75443	2155 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	VWA5A	O00534	786 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	DCX	O43602	365 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	SLC25A27	O95847	323 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	ALAD	P13716	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	NID1	P14543	1247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	AKR1B1	P15121	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	CYP7A1	P22680	504 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	AMPD1	P23109	780 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	STAT3	P40763	770 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	GJA9	P57773	515 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	ICA1	Q05084	483 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	ITGA7	Q13683	1181 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	ACVR2B	Q13705	512 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	CCIN	Q13939	588 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	C16orf46	Q6P387	395 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	ARMCX2	Q7L311	632 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	PLXNA3	P51805	1871 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	MYH4	Q9Y623	1939 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	GNB5	O14775	395 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	ARSD	P51689	593 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	GABPA	Q06546	454 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	TTC6	Q86TZ1	520 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	TLK2	Q86UE8	772 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	REPS2	Q8NFH8	660 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	SPC25	Q9HBM1	224 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	COL4A6	Q14031	1691 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
BRWD1-208	ENST00000445245	FRYL	O94915	3013 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245		M0R082	166 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	NFKB1	P19838	968 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	DEFB103A	P81534	67 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	PLAUR	Q03405	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	TCF15	Q12870	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	CLUL1	Q15846	466 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	DDX11	Q96FC9	970 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	SLC9A7	Q96T83	725 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	VCPKMT	Q9H867	229 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	MRS2	Q9HD23	443 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRWD1-208	ENST00000445245	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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