RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441439.6

LMO3-208, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,515 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-208ENST00000441439 HPDP32754 393 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 ZNF568Q3ZCX4 644 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 MTHFD1LQ6UB35 978 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 ATP8B4Q8TF62 1192 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 KIF9Q9HAQ2 790 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 ZFATQ9P243 1243 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 PRKAG3Q9UGI9 489 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 PCDHA4Q9UN74 947 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 SNX3O60493 162 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 PLS1Q14651 629 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 ZCWPW2Q504Y3 356 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 METTL24Q5JXM2 366 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 TBC1D16Q8TBP0 767 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 MROH7Q68CQ1 1323 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 FAM187AA6NFU0 413 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 PHF20L1A8MW92 1017 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 GFPT2O94808 682 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 PLEKHA8P1O95397 391 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 KLRC1P26715 233 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 PRKCIP41743 596 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 UNC13DQ70J99 1090 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 BLIDQ8IZY5 108 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 GALNT15Q8N3T1 639 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 CEP63Q96MT8 703 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 PANK4Q9NVE7 773 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 STK17AQ9UEE5 414 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-208ENST00000441439 SLC26A4O43511 780 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 IDH1O75874 414 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 CNGA1P29973 690 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 ABL2P42684 1182 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 STK4Q13043 487 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 PDIA5Q14554 519 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 RPS6KA1Q15418 735 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 TRADDQ15628 312 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 SFMBT2Q5VUG0 894 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 RRAGAQ7L523 313 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 IFT74Q96LB3 600 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 TMEM237Q96Q45 408 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 SAMD15Q9P1V8 674 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 AGAP1Q9UPQ3 857 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 CCDC169A6NNP5 214 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 GNA14O95837 355 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 ITGA6P23229 1130 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 PHKA1P46020 1223 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 PDE6CP51160 858 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 COPS2P61201 443 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 LCORLQ8N3X6 602 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 IFT43Q96FT9 208 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 CHN1P15882 459 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 CTSWP56202 376 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 PDE4DQ08499 809 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 RNF43Q68DV7 783 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 DUPD1Q68J44 220 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 TAF4BQ92750 862 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 BICD1Q96G01 975 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 HES6Q96HZ4 224 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 ARMT1Q9H993 441 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 MMEP08473 750 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 RPSAP08865 295 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 ACADSP16219 412 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 MCM7P33993 719 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 PTENP60484 403 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
LMO3-208ENST00000441439 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms