RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440447.2

PTX4-202, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,117 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-202ENST00000440447 CLTBP09497 229 aa20.57■□□□□ 0.88
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PTX4-202ENST00000440447 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.57■□□□□ 0.88
PTX4-202ENST00000440447 TRPV6Q9H1D0 765 aa20.57■□□□□ 0.88
PTX4-202ENST00000440447 RNPEPQ9H4A4 650 aa20.57■□□□□ 0.88
PTX4-202ENST00000440447 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa20.57■□□□□ 0.88
PTX4-202ENST00000440447 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.57■□□□□ 0.88
PTX4-202ENST00000440447 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa20.56■□□□□ 0.88
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PTX4-202ENST00000440447 B4GALT4O60513 344 aa20.56■□□□□ 0.88
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PTX4-202ENST00000440447 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.56■□□□□ 0.88
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PTX4-202ENST00000440447 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.56■□□□□ 0.88
PTX4-202ENST00000440447 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
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PTX4-202ENST00000440447 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
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PTX4-202ENST00000440447 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
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PTX4-202ENST00000440447 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.55■□□□□ 0.88
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PTX4-202ENST00000440447 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
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PTX4-202ENST00000440447 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.54■□□□□ 0.88
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PTX4-202ENST00000440447 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
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PTX4-202ENST00000440447 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.52■□□□□ 0.88
PTX4-202ENST00000440447 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa20.52■□□□□ 0.88
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PTX4-202ENST00000440447 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
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PTX4-202ENST00000440447 OATP04181 439 aa20.5■□□□□ 0.87
PTX4-202ENST00000440447 RAG1P15918 1043 aa20.5■□□□□ 0.87
PTX4-202ENST00000440447 PTK7Q13308 1070 aa20.5■□□□□ 0.87
PTX4-202ENST00000440447 PDIA5Q14554 519 aa20.5■□□□□ 0.87
PTX4-202ENST00000440447 XKR3Q5GH77 459 aa20.5■□□□□ 0.87
PTX4-202ENST00000440447 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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