RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440400.1

ACTN4-204, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ACTN4, Length 3,180 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-204ENST00000440400 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 RBL2Q08999 1139 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 LRCH2Q5VUJ6 765 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 GPBP1Q86WP2 473 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 UNC45AQ9H3U1 944 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 SLC39A2Q9NP94 309 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 DNM3Q9UQ16 869 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 MARCH6O60337 910 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 ARP10275 920 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 DNM2P50570 870 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 SPP2Q13103 211 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 ZSCAN26Q16670 478 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 LBX2Q6XYB7 198 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 CNGA4Q8IV77 575 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 ERO1AQ96HE7 468 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 OLFML3Q9NRN5 406 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 SIP14410 1827 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 UBE4BO95155 1302 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 RASSF10A6NK89 507 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 NRDCO43847 1150 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 PGM5Q15124 567 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 EDRF1Q3B7T1 1238 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 C1orf186Q6ZWK4 172 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 RETREG2Q8NC44 543 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 HPS3Q969F9 1004 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 DNAJC7Q99615 494 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 TAB2Q9NYJ8 693 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 FLOT1O75955 427 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 TEX35Q5T0J7 233 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 DYMQ7RTS9 669 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 TEKT3Q9BXF9 490 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 PXMP2Q9NR77 195 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 COBLO75128 1261 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 SLU7O95391 586 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 ZNF76P36508 570 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 IL31RAQ8NI17 732 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 SCFD1Q8WVM8 642 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 WNK4Q96J92 1243 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 CAPN11Q9UMQ6 739 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-204ENST00000440400 N4BP3O15049 544 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.087e-9■■■□□ 15.1
ACTN4-204ENST00000440400 GAP43P17677 238 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 ATG4CQ96DT6 458 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 ZNF577Q9BSK1 485 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 STRA6Q9BX79 667 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 IRF6O14896 467 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 SLC30A10Q6XR72 485 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 REEP2Q9BRK0 252 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 GUCY2CP25092 1073 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 HOXD13P35453 343 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.086e-8■■■■□ 23.7
ACTN4-204ENST00000440400 COG2Q14746 738 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 MEA1Q16626 185 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 RINT1Q6NUQ1 792 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 GLIS3Q8NEA6 775 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 RDM1Q8NG50 284 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 FIZ1Q96SL8 496 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 NUP58Q9BVL2 599 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 ABHD10Q9NUJ1 306 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 GAS7O60861 476 aa14.57□□□□□ -0.08
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ACTN4-204ENST00000440400 CDK17Q00537 523 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 PDCD2LQ9BRP1 358 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 SYT17Q9BSW7 474 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 KCNH7Q9NS40 1196 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 ODF2LQ9ULJ1 636 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 SIK3Q9Y2K2 1263 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTN4-204ENST00000440400 ANKRD65E5RJM6 399 aa14.57□□□□□ -0.08
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