RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 SCNN1DP51172 638 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 C2orf54Q08AI8 447 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 PTPN21Q16825 1174 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 BBS9Q3SYG4 887 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAJC24Q6P3W2 148 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 UNC5CLQ8IV45 518 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 VSTM4Q8IW00 320 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 GPR108Q9NPR9 543 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDHA4Q9UN74 947 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 GFPT2O94808 682 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ARL4AP40617 200 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 MXI1P50539 228 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 POLE2P56282 527 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 CHRNDQ07001 517 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 E2F4Q16254 413 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 NUGGCQ68CJ6 796 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 MAN1B1Q9UKM7 699 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 SCINQ9Y6U3 715 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCA3Q99758 1704 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 SOWAHDA6NJG2 315 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 SEMA3EO15041 775 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 NR5A1Q13285 461 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 TFDP1Q14186 410 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCB5Q2M3G0 1257 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 C10orf76Q5T2E6 689 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 RPS6KC1Q96S38 1066 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 SPTLC3Q9NUV7 552 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 PTPREP23469 700 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 CDC25AP30304 524 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 HSPA2P54652 639 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM160B1Q5W0V3 765 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 NACC1Q96RE7 527 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.513e-9■□□□□ 9.2
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT82Q9NSB4 513 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGEF10O15013 1369 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 SORBS3O60504 671 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 MOCS3O95396 460 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT1P04264 644 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 TBCKQ8TEA7 893 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ACCSQ96QU6 501 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 NUDCD1Q96RS6 583 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 CLIC2O15247 247 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP3K7O43318 606 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 TOM1L1O75674 476 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 SPOPLQ6IQ16 392 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 EMILIN3Q9NT22 766 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 GCNT4Q9P109 453 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 RWDD2AQ9UIY3 292 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC188H7C350 402 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ART3Q13508 389 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF449Q6P9G9 518 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 EXOC8Q8IYI6 725 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF710Q8N1W2 664 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 PANX2Q96RD6 677 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM206Q9H813 350 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 DYNLT1P63172 113 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 IGBP1P78318 339 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 GRAMD1BQ3KR37 738 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 C6orf118Q5T5N4 469 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF577Q9BSK1 485 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 NDST4Q9H3R1 872 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 GREM2Q9H772 168 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 NCAPD2Q15021 1401 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 SERPING1P05155 500 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 XPAP23025 273 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 NRBF2Q96F24 287 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 SERPINI1Q99574 410 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCB6Q9NP58 842 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 KMT5AQ9NQR1 393 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 PXDNQ92626 1479 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 SPDYE2BA6NHP3 402 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 TCP10L2B9ZVM9 353 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 MMP1P03956 469 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 SPDYE6P0CI01 402 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ADORA1P30542 326 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC12A1Q13621 1099 aa11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms