RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409937.1

CNGA3-204, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CNGA3, Length 2,615 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-204ENST00000409937 ITIH3Q06033 890 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 EMBQ6PCB8 327 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 MICALL1Q8N3F8 863 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 IQCDQ96DY2 449 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 BCS1LQ9Y276 419 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 SERPINB2P05120 415 aa15.46■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 HOXD13P35453 343 aa15.46■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 CFAP58Q5T655 872 aa15.46■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 KSR1Q8IVT5 923 aa15.46■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 ANO3Q9BYT9 981 aa15.46■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 FAM107BQ9H098 131 aa15.46■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 GDF3Q9NR23 364 aa15.46■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 KCNQ5Q9NR82 932 aa15.46■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa15.46■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 IFT20Q8IY31 132 aa15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 CYP2W1Q8TAV3 490 aa15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 CAVIN3Q969G5 261 aa15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 SPAG5Q96R06 1193 aa15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 REEP2Q9BRK0 252 aa15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 FAM169AQ9Y6X4 670 aa15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 CEP104O60308 925 aa15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 OPA1O60313 960 aa15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 ERVK-9P63128 1117 aa15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 MAATS1Q7Z4T9 603 aa15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 CATSPER3Q86XQ3 398 aa15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 PLCD3Q8N3E9 789 aa15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 DNAJC18Q9H819 358 aa15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 SMCHD1A6NHR9 2005 aa15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 TMCO5BA8MYB1 307 aa15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 HPDP32754 393 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 SLC12A3P55017 1021 aa15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 NEUROG2Q9H2A3 272 aa15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 hCG_1984214I3L0E3 225 aa15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 AKAP3O75969 853 aa15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 ITGA4P13612 1032 aa15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 SEC24CP53992 1094 aa15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 KAT2BQ92831 832 aa15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 CEP63Q96MT8 703 aa15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF831Q5JPB2 1677 aa15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 PLIN4Q96Q06 1357 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 TAF1LQ8IZX4 1826 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 BACH1O14867 736 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 CETN3O15182 167 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 GYS1P13807 737 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 UCHL3P15374 230 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 FLT3P36888 993 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 NT5C2P49902 561 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 PAK2Q13177 524 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 NAA35Q5VZE5 725 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 USP38Q8NB14 1042 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 LRRC27Q9C0I9 530 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 ZBTB39O15060 712 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 GDF11O95390 407 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 DDR1Q08345 913 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 GIT2Q14161 759 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 CERS3Q8IU89 383 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 RUSC1Q9BVN2 902 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 NT5C3AQ9H0P0 336 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 RGL1Q9NZL6 768 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 PLAAQ9Y263 795 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 FOCADQ5VW36 1801 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa15.42■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 FAM86B1E9PN63 330 aa15.42■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 EBAG9O00559 213 aa15.42■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 NDUFAB1O14561 156 aa15.42■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 FAM86B2P0C5J1 330 aa15.42■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 EEF2P13639 858 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 PON1P27169 355 aa15.42■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 COPB2P35606 906 aa15.42■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 IKQ13123 557 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 RPS6KA1Q15418 735 aa15.42■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 CRY2Q49AN0 593 aa15.42■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 CEP85LQ5SZL2 805 aa15.42■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 FBXW10Q5XX13 1052 aa15.42■□□□□ 0.06
CNGA3-204ENST00000409937 ALS2CLQ60I27 953 aa15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms