RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 CD109Q6YHK3 1445 aa10.55□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 LAD1O00515 517 aa10.55□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 NOP56O00567 594 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 ANP32DO95626 131 aa10.55□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 REXO1L1PQ8IX06 675 aa10.55□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 PYROXD1Q8WU10 500 aa10.55□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 PCDHA4Q9UN74 947 aa10.55□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 FIS1Q9Y3D6 152 aa10.55□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 AP5Z1O43299 807 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 CPP00450 1065 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 CASP2P42575 452 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 SLC44A4Q53GD3 710 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 RFX6Q8HWS3 928 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 KIAA2013Q8IYS2 634 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 SUPT20HQ8NEM7 779 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 RUBCNQ92622 972 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 HIC2Q96JB3 615 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 ANKRD2Q9GZV1 360 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 VCPKMTQ9H867 229 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 DISC1Q9NRI5 854 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 KRT1P04264 644 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 FGFR4P22455 802 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 PGM1P36871 562 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 ECE1P42892 770 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 TMED10P49755 219 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 CENPUQ71F23 418 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 LRRN4CLQ8ND94 238 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 CFAP36Q96G28 342 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 CYP4F11Q9HBI6 524 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 EHD2Q9NZN4 543 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 SEPT10Q9P0V9 454 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 L1RE1Q9UN81 338 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 MYOM2P54296 1465 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 SHANK2Q9UPX8 1470 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 GNGT2O14610 69 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 MCF2LO15068 1137 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 CFBP00751 764 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 STAT2P52630 851 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 RABGAP1LQ5R372 815 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 RNF207Q6ZRF8 634 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 GRAMD1AQ96CP6 724 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 HDAC11Q96DB2 347 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 KRT82Q9NSB4 513 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 BAG5Q9UL15 447 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 GAS7O60861 476 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 MFAP3P55082 362 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 POLA2Q14181 598 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 UBE3CQ15386 1083 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 PROSER3Q2NL68 480 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 RAPH1Q70E73 1250 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 CEP72Q9P209 647 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 CDHR2Q9BYE9 1310 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 A0A1B0GTH6 734 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 GOLGA8OA6NCC3 632 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 GOLGA8NF8WBI6 632 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 MYBL1P10243 752 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 CARSP49589 748 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 STX1BP61266 288 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 PTK2Q05397 1052 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 MED21Q13503 144 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 CYTH1Q15438 398 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 LRIG3Q6UXM1 1119 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 TRPV6Q9H1D0 765 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 PSTPIP2Q9H939 334 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 SPC25Q9HBM1 224 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 CAPN11Q9UMQ6 739 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 ARHGEF10O15013 1369 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 COPEO14579 308 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 SASH1O94885 1247 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 LRRC63Q05C16 580 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 NBPF20Q3BBV1 942 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 STAG2Q8N3U4 1231 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 MCUQ8NE86 351 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 ERP27Q96DN0 273 aa10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117 ms