RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
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RABGGTA-202ENST00000399409 FAM86B2P0C5J1 330 aa25.4■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 HSPA1LP34931 641 aa25.4■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 NAB2Q15742 525 aa25.4■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 BMT2Q1RMZ1 405 aa25.4■■□□□ 1.66
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RABGGTA-202ENST00000399409 SFR1Q86XK3 245 aa25.39■■□□□ 1.66
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RABGGTA-202ENST00000399409 TLR10Q9BXR5 811 aa25.39■■□□□ 1.66
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RABGGTA-202ENST00000399409 H0YIN7 160 aa25.38■■□□□ 1.65
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RABGGTA-202ENST00000399409 C10orf76Q5T2E6 689 aa25.38■■□□□ 1.65
RABGGTA-202ENST00000399409 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa25.38■■□□□ 1.65
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RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF76P36508 570 aa25.38■■□□□ 1.65
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RABGGTA-202ENST00000399409 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
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RABGGTA-202ENST00000399409 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa25.33■■□□□ 1.64
RABGGTA-202ENST00000399409 CXCR5P32302 372 aa25.33■■□□□ 1.64
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