RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 C17orf102A2RUQ5 167 aa17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SYT1P21579 422 aa17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHMP4BP1P59074 171 aa17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTGISQ16647 500 aa17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MIER3Q7Z3K6 550 aa17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC155Q8N6L0 562 aa17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MTMR9Q96QG7 549 aa17.24■□□□□ 0.35
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VAV3Q9UKW4 847 aa17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIM43BA6NCK2 446 aa17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RRN3P2A6NIE6 340 aa17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LAD1O00515 517 aa17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAG1P15918 1043 aa17.23■□□□□ 0.35
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 MCM7P33993 719 aa17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTK7Q13308 1070 aa17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BFSP2Q13515 415 aa17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BECN1Q14457 450 aa17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SWSAP1Q6NVH7 229 aa17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDXDC2PQ6P474 469 aa17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CAGE1Q8TC20 777 aa17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATP6V0A1Q93050 837 aa17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM167AQ96KS9 214 aa17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UIMC1Q96RL1 719 aa17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIPK3Q9H422 1215 aa17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNPEPQ9H4A4 650 aa17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCDHA12Q9UN75 941 aa17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MCM3APO60318 1980 aa17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PITPNM1O00562 1244 aa17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WNT7AO00755 349 aa17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHMP2AO43633 222 aa17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HBP1O60381 514 aa17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TIMP1P01033 207 aa17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR52Z1P0C646 297 aa17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SYN1P17600 705 aa17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MARK3P27448 753 aa17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RBL2Q08999 1139 aa17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPFIA1Q13136 1202 aa17.22■□□□□ 0.35
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HS6ST3Q8IZP7 471 aa17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATP8B4Q8TF62 1192 aa17.22■□□□□ 0.35
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 POTEB3A0JP26 581 aa17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STX6O43752 255 aa17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CAND2O75155 1236 aa17.21■□□□□ 0.35
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADAM17P78536 824 aa17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPIRE1Q08AE8 756 aa17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLCB4Q15147 1175 aa17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EPHA7Q15375 998 aa17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF174Q15697 407 aa17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TAF2Q6P1X5 1199 aa17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POTEBQ6S5H4 581 aa17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SERINC5Q86VE9 423 aa17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NEK9Q8TD19 979 aa17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GJA10Q969M2 543 aa17.21■□□□□ 0.35
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CEP131Q9UPN4 1083 aa17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRPC6Q9Y210 931 aa17.21■□□□□ 0.35
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 BMP15O95972 392 aa17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BMP8BP34820 402 aa17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRPHP41219 470 aa17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TXKP42681 527 aa17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GRIK4Q16099 956 aa17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF484Q5JVG2 852 aa17.2■□□□□ 0.34
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CKAP2LQ8IYA6 745 aa17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM199Q8N511 208 aa17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LMBR1Q8WVP7 490 aa17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CTAGE1Q96RT6 745 aa17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GDF15Q99988 308 aa17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM60Q9H2L4 133 aa17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SETD4Q9NVD3 440 aa17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 P4HBP07237 508 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYP2C9P11712 490 aa17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 INSRRP14616 1297 aa17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSMC5P62195 406 aa17.19■□□□□ 0.34
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