RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-202ENST00000368205 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-202ENST00000368205 DPH6Q7L8W6 267 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-202ENST00000368205 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-202ENST00000368205 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-202ENST00000368205 ADOQ96SZ5 270 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-202ENST00000368205 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-202ENST00000368205 ST7Q9NRC1 585 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-202ENST00000368205 KLF4O43474 513 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRK-202ENST00000368205 RAC3P60763 192 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRK-202ENST00000368205 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF503Q96F45 646 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-202ENST00000368205 IPPKQ9H8X2 491 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-202ENST00000368205 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-202ENST00000368205 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-202ENST00000368205 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
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PTPRK-202ENST00000368205 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-202ENST00000368205 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
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PTPRK-202ENST00000368205 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
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PTPRK-202ENST00000368205 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-202ENST00000368205 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.37□□□□□ -1.39
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PTPRK-202ENST00000368205 RNF151Q2KHN1 245 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-202ENST00000368205 Q6ZSN1 163 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-202ENST00000368205 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-202ENST00000368205 CD244Q9BZW8 370 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRK-202ENST00000368205 BLACEA4D250 179 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRK-202ENST00000368205 GPR19Q15760 415 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-202ENST00000368205 NRN1LQ496H8 165 aa6.34□□□□□ -1.39
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PTPRK-202ENST00000368205 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-202ENST00000368205 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-202ENST00000368205 AMER2Q8N7J2 671 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-202ENST00000368205 FBXO10Q9UK96 956 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-202ENST00000368205 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 AQP7O14520 342 aa6.33□□□□□ -1.4
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PTPRK-202ENST00000368205 PTH1RQ03431 593 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 ABHD18Q0P651 414 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 PAK1Q13153 545 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 MATN2O00339 956 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 PLSCR1O15162 318 aa6.32□□□□□ -1.4
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PTPRK-202ENST00000368205 ZNF202O95125 648 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 PTGS1P23219 599 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 RAB33AQ14088 237 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 STILQ15468 1287 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 FIGNQ5HY92 759 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 EXTL1Q92935 676 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 FAM89AQ96GI7 184 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 NR2E1Q9Y466 385 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 MAN2B1O00754 1011 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 ARHGAP6O43182 974 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 NARSO43776 548 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 AMY2AP04746 511 aa6.31□□□□□ -1.4
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