RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366974.8

TATDN3-202, Transcript of TatD DNase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TATDN3, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TATDN3-202ENST00000366974 COL4A5P29400 1685 aa16.12■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 ELF1P32519 619 aa16.12■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 C6orf89Q6UWU4 347 aa16.12■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 RRAGAQ7L523 313 aa16.12■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa16.12■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 SPZ1Q9BXG8 430 aa16.12■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 TRIM9Q9C026 710 aa16.12■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 PLCB1Q9NQ66 1216 aa16.12■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 MCM8Q9UJA3 840 aa16.12■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 MYH4Q9Y623 1939 aa16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 GMNCA6NCL1 334 aa16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 USP17L5A8MUK1 530 aa16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 NCK2O43639 380 aa16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 CUL1Q13616 776 aa16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 WLSQ5T9L3 541 aa16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 CLEC10AQ8IUN9 316 aa16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 CYFIP2Q96F07 1278 aa16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 VEZTQ9HBM0 779 aa16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 TMBIM4Q9HC24 238 aa16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 SLC40A1Q9NP59 571 aa16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 LRRC53A6NM62 1247 aa16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 FAM153BP0C7A2 387 aa16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 EZRP15311 586 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 GUCY2FP51841 1108 aa16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 EIF6P56537 245 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 RASSF7Q02833 373 aa16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 FAM153CQ494X1 144 aa16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 CABP7Q86V35 215 aa16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 PIK3R5Q8WYR1 880 aa16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 DNAJC18Q9H819 358 aa16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 CD248Q9HCU0 757 aa16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 FAM153AQ9UHL3 310 aa16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 PLAAQ9Y263 795 aa16.11■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 CES2O00748 559 aa16.1■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 NPM3O75607 178 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 SLC8A1P32418 973 aa16.1■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 CENPHQ9H3R5 247 aa16.1■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 EHD2Q9NZN4 543 aa16.1■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 ODF2LQ9ULJ1 636 aa16.1■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 STXBP3O00186 592 aa16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 PDHBP11177 359 aa16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 SEC24CP53992 1094 aa16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 MTMR3Q13615 1198 aa16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 CENPPQ6IPU0 288 aa16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 PDXDC1Q6P996 788 aa16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 PARP9Q8IXQ6 854 aa16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 TAF4BQ92750 862 aa16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 KRT12Q99456 494 aa16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 BARHL2Q9NY43 387 aa16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 ZBTB7AO95365 584 aa16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 TTLL1O95922 423 aa16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 PLCG1P19174 1290 aa16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 SMARCA1P28370 1054 aa16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 STK4Q13043 487 aa16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 LARGE2Q8N3Y3 721 aa16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 DAGLBQ8NCG7 672 aa16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 BANK1Q8NDB2 785 aa16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 MTMR8Q96EF0 704 aa16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 MS4A14Q96JA4 679 aa16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 ISCUQ9H1K1 167 aa16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 PI4KBQ9UBF8 816 aa16.09■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 FAM196BA6NMK8 535 aa16.08■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 PP2D1A8MPX8 630 aa16.08■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 BUB1O43683 1085 aa16.08■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 LRRC63Q05C16 580 aa16.08■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 SGSM3Q96HU1 749 aa16.08■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 PLIN2Q99541 437 aa16.08■□□□□ 0.17
TATDN3-202ENST00000366974 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TATDN3-202ENST00000366974 M0R2N6 131 aa16.08■□□□□ 0.16
TATDN3-202ENST00000366974 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TATDN3-202ENST00000366974 RAD17O75943 681 aa16.08■□□□□ 0.16
TATDN3-202ENST00000366974 SERPING1P05155 500 aa16.08■□□□□ 0.16
TATDN3-202ENST00000366974 SNHG28P0DPA3 235 aa16.08■□□□□ 0.16
TATDN3-202ENST00000366974 HPDP32754 393 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TATDN3-202ENST00000366974 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
TATDN3-202ENST00000366974 EEF2KMTQ96G04 330 aa16.08■□□□□ 0.16
TATDN3-202ENST00000366974 CCDC17Q96LX7 622 aa16.08■□□□□ 0.16
TATDN3-202ENST00000366974 ESYT3A0FGR9 886 aa16.07■□□□□ 0.16
TATDN3-202ENST00000366974 SLC1A4P43007 532 aa16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms