RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 AZI2Q9H6S1 392 aa30.56■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 BRMS1Q9HCU9 246 aa30.56■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 STAT5BP51692 787 aa30.55■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 PLCB4Q15147 1175 aa30.55■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 DEFB128Q7Z7B8 93 aa30.55■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 RETREG2Q8NC44 543 aa30.55■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 C8orf76Q96K31 380 aa30.55■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 UNC45AQ9H3U1 944 aa30.55■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 BACH1O14867 736 aa30.54■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 CHMP2AO43633 222 aa30.54■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 GRIK4Q16099 956 aa30.54■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF618Q5T7W0 954 aa30.54■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 LRCH2Q5VUJ6 765 aa30.54■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa30.54■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC8DQ7L1W4 858 aa30.54■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa30.54■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 AFAP1L1Q8TED9 768 aa30.54■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 LAMA3Q16787 3333 aa30.54■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 NRCAMQ92823 1304 aa30.53■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 GAS7O60861 476 aa30.53■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 PSMD10O75832 226 aa30.53■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 SELPP16109 830 aa30.53■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 KRT76Q01546 638 aa30.53■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 MARCH8Q5T0T0 291 aa30.53■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 SWSAP1Q6NVH7 229 aa30.53■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 RUFY4Q6ZNE9 571 aa30.53■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC155Q8N6L0 562 aa30.53■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa30.53■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 RIT2Q99578 217 aa30.53■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 TEKT3Q9BXF9 490 aa30.53■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 INSRRP14616 1297 aa30.52■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 ATP4AP20648 1035 aa30.52■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 IGBP1P78318 339 aa30.52■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 FAM184AQ8NB25 1140 aa30.52■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF302Q9NR11 478 aa30.52■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 TRPC6Q9Y210 931 aa30.52■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 MBTPS1Q14703 1052 aa30.51■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 PPP4R3AQ6IN85 833 aa30.51■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 OTOP2Q7RTS6 562 aa30.51■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 POTEDQ86YR6 584 aa30.51■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 KCNMB3Q9NPA1 279 aa30.51■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 NBNO60934 754 aa30.5■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 THPOP40225 353 aa30.5■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 RASIP1Q5U651 963 aa30.5■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 PDXDC2PQ6P474 469 aa30.5■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 B3GNT9Q6UX72 402 aa30.5■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa30.5■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 DISC1Q9NRI5 854 aa30.5■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 GABBR1Q9UBS5 961 aa30.5■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 SAMM50Q9Y512 469 aa30.5■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa30.5■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 TANC1Q9C0D5 1861 aa30.49■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 WDR64B1ANS9 1081 aa30.49■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 FGBP02675 491 aa30.49■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 PSAPP07602 524 aa30.49■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 GNAT1P11488 350 aa30.49■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 MCM2P49736 904 aa30.49■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 UGCGQ16739 394 aa30.49■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 TCTN1Q2MV58 587 aa30.49■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 FAM160B1Q5W0V3 765 aa30.49■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 IL27Q8NEV9 243 aa30.49■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 HAS1Q92839 578 aa30.49■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 OSBPL7Q9BZF2 842 aa30.49■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa30.49■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 TUBE1Q9UJT0 475 aa30.49■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa30.48■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 POTEB3A0JP26 581 aa30.48■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 KIF28PB7ZC32 967 aa30.48■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 CTSHP09668 335 aa30.48■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 POTEBQ6S5H4 581 aa30.48■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 HERVK_113Q902F9 699 aa30.48■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 VAV3Q9UKW4 847 aa30.48■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 RFC2P35250 354 aa30.47■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 ATP8B4Q8TF62 1192 aa30.47■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF862O60290 1169 aa30.46■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 SLC26A2P50443 739 aa30.46■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP30.46■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 SCN5AQ14524 2016 aa30.46■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 GRXCR1A8MXD5 290 aa30.45■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 ZBTB42B2RXF5 422 aa30.45■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 EML1O00423 815 aa30.45■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 PFKMP08237 780 aa30.45■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 MIER3Q7Z3K6 550 aa30.45■■■□□ 2.47
TPGS1-201ENST00000359315 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP30.45■■■□□ 2.475e-7■■■■■ 33.1
TPGS1-201ENST00000359315 RSPH10B2B2RC85 870 aa30.44■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 RSPH10BP0C881 870 aa30.44■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 ATP2B1P20020 1258 aa30.44■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 GJB2P29033 226 aa30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms