RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
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PTPRU-201ENST00000345512 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
PTPRU-201ENST00000345512 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
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PTPRU-201ENST00000345512 CCDC17Q96LX7 622 aa16.89■□□□□ 0.29
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PTPRU-201ENST00000345512 CPXCR1Q8N123 301 aa16.88■□□□□ 0.29
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PTPRU-201ENST00000345512 ARHGAP23Q9P227 1491 aa16.88■□□□□ 0.29
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PTPRU-201ENST00000345512 GOLPH3Q9H4A6 298 aa16.88■□□□□ 0.29
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PTPRU-201ENST00000345512 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
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PTPRU-201ENST00000345512 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
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PTPRU-201ENST00000345512 HOMER2Q9NSB8 354 aa16.86■□□□□ 0.29
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PTPRU-201ENST00000345512 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
PTPRU-201ENST00000345512 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
PTPRU-201ENST00000345512 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.29
PTPRU-201ENST00000345512 ADGRF4Q8IZF3 695 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRU-201ENST00000345512 FRMD3A2A2Y4 597 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRU-201ENST00000345512 SNX1Q13596 522 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRU-201ENST00000345512 LIN9Q5TKA1 542 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRU-201ENST00000345512 PARVGQ9HBI0 331 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRU-201ENST00000345512 RASGRF2O14827 1237 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRU-201ENST00000345512 CHUKO15111 745 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRU-201ENST00000345512 FIGNQ5HY92 759 aa16.85■□□□□ 0.29
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