RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 C4orf32Q8N8J7 132 aa30.15■■■□□ 2.42
CRIP1-201ENST00000330233 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
CRIP1-201ENST00000330233 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
CRIP1-201ENST00000330233 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
CRIP1-201ENST00000330233 NR2E3Q9Y5X4 410 aa30.14■■■□□ 2.42
CRIP1-201ENST00000330233 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 PDXDC2PQ6P474 469 aa30.13■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 FAM126BQ8IXS8 530 aa30.13■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 RNPEPQ9H4A4 650 aa30.13■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 HDAC6Q9UBN7 1215 aa30.13■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 CEP131Q9UPN4 1083 aa30.13■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa30.13■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 BMP15O95972 392 aa30.12■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 PRPHP41219 470 aa30.12■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 GABBR1Q9UBS5 961 aa30.12■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa30.12■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 GNAT1P11488 350 aa30.11■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 SPIRE1Q08AE8 756 aa30.11■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 EPHA7Q15375 998 aa30.11■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM266Q2M3C6 531 aa30.11■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 MYH15Q9Y2K3 1946 aa30.1■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 EML1O00423 815 aa30.1■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 CD4P01730 458 aa30.1■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa30.1■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa30.1■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 MARK3P27448 753 aa30.1■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 NCAPH2Q6IBW4 605 aa30.1■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 C7orf61Q8IZ16 206 aa30.1■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 ATP6V0A1Q93050 837 aa30.1■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 NRCAMQ92823 1304 aa30.09■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 F13A1P00488 732 aa30.09■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 CLTBP09497 229 aa30.09■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 TECP42680 631 aa30.09■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 PDIA5Q14554 519 aa30.09■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 PLCB4Q15147 1175 aa30.09■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 CKAP2LQ8IYA6 745 aa30.09■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 RAB34Q9BZG1 259 aa30.09■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 POTEB3A0JP26 581 aa30.08■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 C17orf102A2RUQ5 167 aa30.08■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 B4GALT4O60513 344 aa30.08■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP30.08■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 P4HBP07237 508 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP30.08■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 FAAP100Q0VG06 881 aa30.08■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 POTEBQ6S5H4 581 aa30.08■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 DTHD1Q6ZMT9 781 aa30.08■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa30.08■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 TRPV6Q9H1D0 765 aa30.08■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa30.08■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa30.07■■■□□ 2.41
CRIP1-201ENST00000330233 RRN3P2A6NIE6 340 aa30.07■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 HBP1O60381 514 aa30.07■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 PSMC5P62195 406 aa30.07■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 PTGISQ16647 500 aa30.07■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 ATP8B4Q8TF62 1192 aa30.07■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 FAM167AQ96KS9 214 aa30.07■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 NRBP2Q9NSY0 501 aa30.07■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM39AQ9NV64 488 aa30.07■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 TRPC6Q9Y210 931 aa30.07■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 NOD1Q9Y239 953 aa30.07■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 ATP4AP20648 1035 aa30.06■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 HOXC8P31273 242 aa30.06■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 QARSP47897 775 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 PKP1Q13835 747 aa30.06■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 FAM173BQ6P4H8 233 aa30.06■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 SETD4Q9NVD3 440 aa30.06■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 STK24Q9Y6E0 443 aa30.06■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 BRD1O95696 1058 aa30.05■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 PPFIA1Q13136 1202 aa30.05■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 ERMNQ8TAM6 284 aa30.05■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 NEK9Q8TD19 979 aa30.05■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 INSRRP14616 1297 aa30.04■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 PDLIM7Q9NR12 457 aa30.04■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 POTEMA6NI47 508 aa30.03■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 GRIK4Q16099 956 aa30.03■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 UGCGQ16739 394 aa30.03■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF484Q5JVG2 852 aa30.03■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 ATL3Q6DD88 541 aa30.03■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 BANK1Q8NDB2 785 aa30.03■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 HSD17B14Q9BPX1 270 aa30.03■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 LRWD1Q9UFC0 647 aa30.03■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 CLIC4Q9Y696 253 aa30.03■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 COL1A2P08123 1366 aa30.03■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 KIAA0355O15063 1070 aa30.02■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF862O60290 1169 aa30.02■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 OATP04181 439 aa30.02■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 ADAM17P78536 824 aa30.02■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 PTK7Q13308 1070 aa30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms