RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP25.25■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 RPTORQ8N122 1335 aa25.25■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 CETN3O15182 167 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 ALAS1P13196 640 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 MTMR2Q13614 643 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 CCDC122Q5T0U0 273 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 B3GNT9Q6UX72 402 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 RRAGAQ7L523 313 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 KIAA1328Q86T90 577 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 BAP1Q92560 729 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 TEKT3Q9BXF9 490 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 CDC23Q9UJX2 597 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 LRRC53A6NM62 1247 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 FZD9O00144 591 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 ZNF662Q6ZS27 426 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 C1orf186Q6ZWK4 172 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 IL31RAQ8NI17 732 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 CCDC42Q96M95 316 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 SFI1A8K8P3 1242 aa25.23■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 FLOT1O75955 427 aa25.23■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 VCAM1P19320 739 aa25.23■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 BMT2Q1RMZ1 405 aa25.23■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.23■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 MCF2L2Q86YR7 1114 aa25.23■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 HOMER2Q9NSB8 354 aa25.23■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 RCCD1A6NED2 376 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 CYP27A1Q02318 531 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 EPHA7Q15375 998 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 MUM1L1Q5H9M0 696 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 JAKMIP2Q96AA8 810 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 EDEM3Q9BZQ6 932 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 OLFML3Q9NRN5 406 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 PDXKO00764 312 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 GCNT3O95395 438 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 GAP43P17677 238 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 MUTP22033 750 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 GHRHRQ02643 423 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 RIT2Q99578 217 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 LACRTQ9GZZ8 138 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 FAM184BQ9ULE4 1060 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 ZNF263O14978 683 aa25.21■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 FAM13AO94988 1023 aa25.21■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 TUBB2AQ13885 445 aa25.21■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 PDXDC1Q6P996 788 aa25.21■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa25.21■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 NACC1Q96RE7 527 aa25.21■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 TUBB2BQ9BVA1 445 aa25.21■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 KCNH7Q9NS40 1196 aa25.21■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa25.21■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 CALUO43852 315 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 NOL4O94818 638 aa25.21■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 BCRP11274 1271 aa25.21■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 CRACR2AQ9BSW2 395 aa25.21■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 PKD2L1Q9P0L9 805 aa25.21■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.21■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 ASTN1O14525 1302 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 KRT86O43790 486 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 KCNA1Q09470 495 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 TEX35Q5T0J7 233 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 GPIHBP1Q8IV16 184 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 LXNQ9BS40 222 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 EPC1Q9H2F5 836 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 FRMPD4Q14CM0 1322 aa25.19■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 SPP2Q13103 211 aa25.19■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa25.19■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 MYCT1Q8N699 235 aa25.19■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 BANK1Q8NDB2 785 aa25.19■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 NLRC4Q9NPP4 1024 aa25.19■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 CEP72Q9P209 647 aa25.19■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 SPDYE4A6NLX3 237 aa25.19■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 KCNH2Q12809 1159 aa25.19■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 SPA17Q15506 151 aa25.19■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.19■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 FRMD5Q7Z6J6 570 aa25.19■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 GOLGA1Q92805 767 aa25.19■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa25.19■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 ZNF541Q9H0D2 1346 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 TFRCP02786 760 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 NR3C1P04150 777 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 NMT1P30419 496 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 KIF11P52732 1056 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 VAV2P52735 878 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 PCNX4Q63HM2 1172 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 NIPA1Q7RTP0 329 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 CCDC125Q86Z20 511 aa25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms