RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.17■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 PDXDC2PQ6P474 469 aa20.17■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 NECAB2Q7Z6G3 386 aa20.17■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 GSDMAQ96QA5 445 aa20.17■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 TUBE1Q9UJT0 475 aa20.17■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 OGDHLQ9ULD0 1010 aa20.17■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 CYP2C19P33261 490 aa20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 TYRO3Q06418 890 aa20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 GRB10Q13322 594 aa20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 B3GNT9Q6UX72 402 aa20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 MIER3Q7Z3K6 550 aa20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 DACH1Q9UI36 760 aa20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 DNM3Q9UQ16 869 aa20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 WDR64B1ANS9 1081 aa20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 NEDD9Q14511 834 aa20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 FUCA2Q9BTY2 467 aa20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 DHX15O43143 795 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 EVI5O60447 810 aa20.14■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 IGHA2P01877 340 aa20.14■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 P4HBP07237 508 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.14■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.14■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 RAD54LQ92698 747 aa20.14■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 MAML3Q96JK9 1138 aa20.14■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 UNC45AQ9H3U1 944 aa20.14■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 RGS20O76081 388 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 AFMP43652 599 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 NLRP12P59046 1061 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 PNOCQ13519 176 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 NAALADL2Q58DX5 795 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 LHX8Q68G74 356 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 SPATA20Q8TB22 786 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 GJA10Q969M2 543 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 PNMA5Q96PV4 448 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 NACC1Q96RE7 527 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 HSD17B14Q9BPX1 270 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 VTA1Q9NP79 307 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 SAMM50Q9Y512 469 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.13■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 CHMP2AO43633 222 aa20.12■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 CNGA1P29973 690 aa20.12■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 SARSP49591 514 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 MRE11P49959 708 aa20.12■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 DPYDQ12882 1025 aa20.12■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.12■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.12■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 C11orf49Q9H6J7 331 aa20.12■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.12■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.12■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 KCNA2P16389 499 aa20.11■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 SEPT14Q6ZU15 432 aa20.11■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 ARMCX2Q7L311 632 aa20.11■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 TRPV1Q8NER1 839 aa20.11■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 SCFD2Q8WU76 684 aa20.11■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 PLIN2Q99541 437 aa20.11■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 SLC9A2Q9UBY0 812 aa20.11■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa20.11■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.11■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 POTEB3A0JP26 581 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 FSD2A1L4K1 749 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 EML1O00423 815 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 MSCO60682 206 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 MED24O75448 989 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 SLITRK3O94933 977 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 LYPLA2O95372 231 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 PSAPP07602 524 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 CYBAP13498 195 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 PPP1R2P41236 205 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 QARSP47897 775 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 TTLL4Q14679 1199 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 KCNB1Q14721 858 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 POTEBQ6S5H4 581 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 TPH2Q8IWU9 490 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 MLKLQ8NB16 471 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 KATNBL1Q9H079 304 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 KCND2Q9NZV8 630 aa20.1■□□□□ 0.81
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