RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321556.4

PINK1-201, Transcript of PTEN induced putative kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PINK1, Length 2,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PINK1-201ENST00000321556 CLIC2O15247 247 aa25.97■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 GDF11O95390 407 aa25.97■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 IKQ13123 557 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 HYIQ5T013 277 aa25.97■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 KIAA0825Q8IV33 1275 aa25.97■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 REEP2Q9BRK0 252 aa25.97■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 GRID2IPA4D2P6 1211 aa25.96■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 ITIH3Q06033 890 aa25.96■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 SEPT2Q15019 361 aa25.96■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 EDEM3Q9BZQ6 932 aa25.96■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 LY75O60449 1722 aa25.96■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 CETN3O15182 167 aa25.96■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 HLA-DOAP06340 250 aa25.96■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 POLD1P28340 1107 aa25.96■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 CASP4P49662 377 aa25.96■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 IRAK1P51617 712 aa25.96■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 SLFN13Q68D06 897 aa25.96■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 SWAP70Q9UH65 585 aa25.96■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 G3V3G9 751 aa25.95■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 ATP1A2P50993 1020 aa25.95■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 ARHGAP4P98171 946 aa25.95■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 GIT2Q14161 759 aa25.95■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.95■■□□□ 1.75
PINK1-201ENST00000321556 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.95■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 FAM86B1E9PN63 330 aa25.95■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 FAM86B2P0C5J1 330 aa25.95■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 COA1Q9GZY4 146 aa25.95■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 PPFIA4O75335 1185 aa25.94■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 NOP2P46087 812 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 CCT5P48643 541 aa25.94■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 MEI1Q5TIA1 1274 aa25.94■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 SPAG5Q96R06 1193 aa25.94■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 SPIRE1Q08AE8 756 aa25.94■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 RUFY1Q96T51 708 aa25.94■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 KCNK3O14649 394 aa25.93■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa25.93■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 GNGT1P63211 74 aa25.93■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa25.93■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 RGL1Q9NZL6 768 aa25.93■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 HSF2BPO75031 334 aa25.93■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 AKAP3O75969 853 aa25.93■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 KSR1Q8IVT5 923 aa25.93■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 TEKT1Q969V4 418 aa25.93■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 CAPS2Q9BXY5 557 aa25.93■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa25.92■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25.92■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 SP8Q8IXZ3 490 aa25.92■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 ETNPPLQ8TBG4 499 aa25.92■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.92■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 BHMT2Q9H2M3 363 aa25.92■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.92■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 ZBTB39O15060 712 aa25.92■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 GNA14O95837 355 aa25.92■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 UCHL3P15374 230 aa25.92■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 EMBQ6PCB8 327 aa25.92■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 AIPL1Q9NZN9 384 aa25.92■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 RAD51CO43502 376 aa25.91■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 PDCLQ13371 301 aa25.91■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 IFT20Q8IY31 132 aa25.91■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 SPICE1Q8N0Z3 855 aa25.91■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 PIGOQ8TEQ8 1089 aa25.91■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 SH3GL2Q99962 352 aa25.91■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 RUSC1Q9BVN2 902 aa25.91■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 AP1M1Q9BXS5 423 aa25.91■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa25.91■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 CRKP46108 304 aa25.91■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa25.91■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 DNM3Q9UQ16 869 aa25.91■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa25.91■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 TOM1O60784 492 aa25.91■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 PON1P27169 355 aa25.91■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 MARSP56192 900 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 SAMM50Q9Y512 469 aa25.91■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 USP11P51784 963 aa25.9■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa25.9■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 BCAS4Q8TDM0 211 aa25.9■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 LENG9Q96B70 501 aa25.9■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 GDF3Q9NR23 364 aa25.9■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.9■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 GCNT3O95395 438 aa25.9■■□□□ 1.74
PINK1-201ENST00000321556 JAG1P78504 1218 aa25.9■■□□□ 1.74
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