RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284483.12

TNIK-201, Transcript of TRAF2 and NCK interacting kinase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNIK, Length 4,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIK-201ENST00000284483 CCDC80Q76M96 950 aa10□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 CYB5R4Q7L1T6 521 aa10□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 DPH6Q7L8W6 267 aa10□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 CROCCP2Q86T23 111 aa10□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 PAF1Q8N7H5 531 aa10□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 DYDC2Q96IM9 177 aa10□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 RPS6KC1Q96S38 1066 aa10□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 FBXL5Q9UKA1 691 aa10□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 LRRC53A6NM62 1247 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 UBE2Q2LH0YL09 131 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 C6orf229H3BNL8 230 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 SMAPO00193 183 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 FGGP02679 453 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 RFC5P40937 340 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 NR1I3Q14994 352 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 TMEM154Q6P9G4 183 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 TBC1D10CQ8IV04 446 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 FGD4Q96M96 766 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 NRXN1Q9ULB1 1477 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 SMCO2A6NFE2 343 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 GAS8O95995 478 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 IGKV5-2P06315 115 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 VCAM1P19320 739 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 FAM26FQ5R3K3 315 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 RFX8Q6ZV50 586 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 LRRC8CQ8TDW0 803 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 BRD8Q9H0E9 1235 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 TUBE1Q9UJT0 475 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 ANO9A1A5B4 782 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 DAPK3O43293 454 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 LRRN2O75325 713 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 CCND1P24385 295 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 CCNE1P24864 410 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 BCAMP50895 628 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 SLF2Q8IX21 1173 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 CTAGE3PQ8IX95 158 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 DDX12PQ92771 950 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 KIFAP3Q92845 792 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 ZMYND12Q9H0C1 365 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 SYNCQ9H7C4 482 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 AMACRQ9UHK6 382 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 SNX12Q9UMY4 172 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 SH3TC1Q8TE82 1336 aa9.99□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 ZNF233A6NK53 670 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 CYP2J2P51589 502 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 RAD23BP54727 409 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 TMED1Q13445 227 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 MAN2A1Q16706 1144 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 ARHGAP24Q8N264 748 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 SMYD1Q8NB12 490 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 MDM1Q8TC05 714 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 GOLPH3Q9H4A6 298 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 SLC52A2Q9HAB3 445 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 A8MUI8 341 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 EXOC3O60645 756 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 PLEKHA8P1O95397 391 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 OR52Z1P0C646 297 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 CCDC24Q8N4L8 307 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 HIPK4Q8NE63 616 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 MORC4Q8TE76 937 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 HPS3Q969F9 1004 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 CHMP6Q96FZ7 201 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 DCAF5Q96JK2 942 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 ADAM33Q9BZ11 813 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 WDR37Q9Y2I8 494 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 KCNA6P17658 529 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 PLCG1P19174 1290 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 EXOC3L4Q17RC7 722 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 GPBP1Q86WP2 473 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 ATP11CQ8NB49 1132 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TNIK-201ENST00000284483 TTC37Q6PGP7 1564 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms