RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261637.4

UTP20-201, Transcript of UTP20, small subunit processome component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UTP20, Length 9,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP20-201ENST00000261637 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 CNGA4Q8IV77 575 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 EXOC8Q8IYI6 725 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 ATP6V0A1Q93050 837 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 ERLEC1Q96DZ1 483 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 COG4Q9H9E3 785 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 POLD4Q9HCU8 107 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 H0YCG3 227 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 BUB1O43683 1085 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 GARSP41250 739 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 IFT88Q13099 833 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 PTK2BQ14289 1009 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 KRT40Q6A162 431 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 GJA10Q969M2 543 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 CLIC6Q96NY7 704 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 TTC1Q99614 292 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 SERTAD1Q9UHV2 236 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 KLF15Q9UIH9 416 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 PCDHA12Q9UN75 941 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 TMEM94Q12767 1356 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 PRR23AA6NEV1 266 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 FAM196BA6NMK8 535 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 PFKFB2O60825 505 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 SRGAP2O75044 1071 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 PHKG2P15735 406 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 CASP14P31944 242 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 MYO1EQ12965 1108 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 PNMA1Q8ND90 353 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 MIPOL1Q8TD10 442 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 CFAP36Q96G28 342 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 PIGSQ96S52 555 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 KCND1Q9NSA2 647 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 HDAC6Q9UBN7 1215 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 TBX22Q9Y458 520 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 HMBSP08397 361 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 PAX7P23759 505 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 CHRNA5P30532 468 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 TSPY1Q01534 308 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 PDXDC2PQ6P474 469 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 BLIDQ8IZY5 108 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 DNAAF3Q8N9W5 541 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 PPFIBP2Q8ND30 876 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 MFSD1Q9H3U5 465 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 SLC39A2Q9NP94 309 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 HPCAL4Q9UM19 191 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 ARHGAP42A6NI28 874 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 CLIC2O15247 247 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 VCPP55072 806 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 C2orf54Q08AI8 447 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 PDCLQ13371 301 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 MMEL1Q495T6 779 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 TMEM259Q4ZIN3 620 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 RNF207Q6ZRF8 634 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 SMIM5Q71RC9 77 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 PEX26Q7Z412 305 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 NT5C3AQ9H0P0 336 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 ATG3Q9NT62 314 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 A0A1W2PQ27 194 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 A0A1W2PQ64 194 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 A0A1W2PQD8 194 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 TUBBP07437 444 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 BMP3P12645 472 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 VAV2P52735 878 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 IRX4P78413 519 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 TUBB2AQ13885 445 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 C8orf74Q6P047 294 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 CCDC13Q8IYE1 715 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 IFNL3Q8IZI9 196 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 RASGRP4Q8TDF6 673 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 HSPH1Q92598 858 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 TUBB2BQ9BVA1 445 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 IGFLR1Q9H665 355 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 MYH15Q9Y2K3 1946 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 PI4K2BG5E9Z4 385 aa4.8□□□□□ -1.64
UTP20-201ENST00000261637 SGK1O00141 431 aa4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms