RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 COPEO14579 308 aa17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 CAV1Q03135 178 aa17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 AOC3Q16853 763 aa17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 RHOT2Q8IXI1 618 aa17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 RNF169Q8NCN4 708 aa17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 DPF2Q92785 391 aa17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 GINM1Q9NU53 330 aa17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 ITSN2Q9NZM3 1697 aa17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 PDE6AP16499 860 aa17.25■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 CASP2P42575 452 aa17.25■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 HDAC4P56524 1084 aa17.25■□□□□ 0.35
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CTIF-201ENST00000256413 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa17.25■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
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CTIF-201ENST00000256413 GNAT1P11488 350 aa17.25■□□□□ 0.35
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CTIF-201ENST00000256413 TTC26A0AVF1 554 aa17.25■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 FAM186BQ8IYM0 893 aa17.25■□□□□ 0.35
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CTIF-201ENST00000256413 SUGCTQ9HAC7 445 aa17.25■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
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CTIF-201ENST00000256413 PTPREP23469 700 aa17.25■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 TRIM50Q86XT4 487 aa17.25■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 CATSPER1Q8NEC5 780 aa17.25■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 ZNF229Q9UJW7 825 aa17.25■□□□□ 0.35
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CTIF-201ENST00000256413 KRT1P04264 644 aa17.24■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 IFNAR1P17181 557 aa17.24■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 RABGAP1LQ5R372 815 aa17.24■□□□□ 0.35
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CTIF-201ENST00000256413 POLD4Q9HCU8 107 aa17.24■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 DAB1O75553 588 aa17.24■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 TRPC1P48995 793 aa17.24■□□□□ 0.35
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CTIF-201ENST00000256413 MID2Q9UJV3 735 aa17.24■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 LRRC53A6NM62 1247 aa17.24■□□□□ 0.35
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CTIF-201ENST00000256413 ANP32DO95626 131 aa17.24■□□□□ 0.35
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CTIF-201ENST00000256413 CUL4BQ13620 913 aa17.24■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 RASGRP2Q7LDG7 609 aa17.24■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 KIF2BQ8N4N8 673 aa17.24■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 NT5C1BQ96P26 610 aa17.24■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 RNF207Q6ZRF8 634 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 SETDB2Q96T68 719 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 ZNF185O15231 689 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 PDE8AO60658 829 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 GFAPP14136 432 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 PNMA1Q8ND90 353 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 CCDC127Q96BQ5 260 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 TTC25Q96NG3 672 aa17.23■□□□□ 0.35
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CTIF-201ENST00000256413 ZIM3Q96PE6 472 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 LGR6Q9HBX8 967 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 PAX7P23759 505 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 CDC25AP30304 524 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 CHRNA2Q15822 529 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 PCDHA4Q9UN74 947 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 KIAA1024Q9UPX6 916 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 USP17L12C9JPN9 530 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 USP17L21D6R901 530 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 MAST3O60307 1309 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 ESRRBO95718 433 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 PCGF5Q86SE9 256 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 PI4K2BQ8TCG2 481 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 NYXQ9GZU5 481 aa17.23■□□□□ 0.35
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