RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.64
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HOXD9-201ENST00000249499 ALAS1P13196 640 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD9-201ENST00000249499 MAP3K9P80192 1104 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD9-201ENST00000249499 PPP2R3AQ06190 1150 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD9-201ENST00000249499 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD9-201ENST00000249499 C1orf186Q6ZWK4 172 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD9-201ENST00000249499 TRIM59Q8IWR1 403 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD9-201ENST00000249499 TPH2Q8IWU9 490 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD9-201ENST00000249499 ACRBPQ8NEB7 543 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD9-201ENST00000249499 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
HOXD9-201ENST00000249499 RUSC1Q9BVN2 902 aa25.28■■□□□ 1.64
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HOXD9-201ENST00000249499 C19orf81C9J6K1 198 aa25.27■■□□□ 1.64
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HOXD9-201ENST00000249499 ITGB5P18084 799 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD9-201ENST00000249499 OAZ1P54368 228 aa25.27■■□□□ 1.64
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HOXD9-201ENST00000249499 NELFCDQ8IXH7 590 aa25.27■■□□□ 1.64
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HOXD9-201ENST00000249499 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD9-201ENST00000249499 UBE4BO95155 1302 aa25.26■■□□□ 1.63
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HOXD9-201ENST00000249499 PTPRAP18433 802 aa25.26■■□□□ 1.63
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HOXD9-201ENST00000249499 SPP2Q13103 211 aa25.26■■□□□ 1.63
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HOXD9-201ENST00000249499 GPRC5DQ9NZD1 345 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 CHMP2AO43633 222 aa25.26■■□□□ 1.63
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HOXD9-201ENST00000249499 CPXCR1Q8N123 301 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 GPC2Q8N158 579 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 KCNH7Q9NS40 1196 aa25.26■■□□□ 1.63
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HOXD9-201ENST00000249499 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
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HOXD9-201ENST00000249499 ARHGAP25P42331 645 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 NFIL3Q16649 462 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 FRMD5Q7Z6J6 570 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 WRNIP1Q96S55 665 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 FAM13AO94988 1023 aa25.24■■□□□ 1.63
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HOXD9-201ENST00000249499 RPL13P26373 211 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 CASP5P51878 434 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF131P52739 623 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 TKFCQ3LXA3 575 aa25.24■■□□□ 1.63
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HOXD9-201ENST00000249499 TBC1D22BQ9NU19 505 aa25.24■■□□□ 1.63
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HOXD9-201ENST00000249499 MRFAP1Q9Y605 127 aa25.24■■□□□ 1.63
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HOXD9-201ENST00000249499 PIGOQ8TEQ8 1089 aa25.23■■□□□ 1.63
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HOXD9-201ENST00000249499 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 RPS6P62753 249 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 MNS1Q8NEH6 495 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 TRERF1Q96PN7 1200 aa25.23■■□□□ 1.63
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HOXD9-201ENST00000249499 MMRN2Q9H8L6 949 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 DHX15O43143 795 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 LYPLA2O95372 231 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 P4HBP07237 508 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 MIER3Q7Z3K6 550 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 EHBP1Q8NDI1 1231 aa25.22■■□□□ 1.63
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HOXD9-201ENST00000249499 KLRG1Q96E93 195 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
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HOXD9-201ENST00000249499 HOXD13P35453 343 aa25.21■■□□□ 1.63
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HOXD9-201ENST00000249499 RNF207Q6ZRF8 634 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 CEP72Q9P209 647 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 ATP2A1O14983 1001 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 GCNT3O95395 438 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 MYBP10242 640 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXD9-201ENST00000249499 KCNMA1Q12791 1236 aa25.21■■□□□ 1.63
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