RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 CALM2P0DP24 149 aa23.17■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 CALM3P0DP25 149 aa23.17■■□□□ 1.3
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ODC1-201ENST00000234111 DPPA5A6NC42 116 aa23.16■■□□□ 1.3
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ODC1-201ENST00000234111 MAGEF1Q9HAY2 307 aa23.15■■□□□ 1.3
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ODC1-201ENST00000234111 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa23.14■■□□□ 1.29
ODC1-201ENST00000234111 MAP3K13O43283 966 aa23.14■■□□□ 1.29
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ODC1-201ENST00000234111 LRRC57Q8N9N7 239 aa23.13■■□□□ 1.29
ODC1-201ENST00000234111 PGM2Q96G03 612 aa23.13■■□□□ 1.29
ODC1-201ENST00000234111 RAB17Q9H0T7 212 aa23.13■■□□□ 1.29
ODC1-201ENST00000234111 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
ODC1-201ENST00000234111 PCDHA4Q9UN74 947 aa23.13■■□□□ 1.29
ODC1-201ENST00000234111 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.13■■□□□ 1.29
ODC1-201ENST00000234111 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
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ODC1-201ENST00000234111 CCNG1P51959 295 aa23.13■■□□□ 1.29
ODC1-201ENST00000234111 COBLL1Q53SF7 1204 aa23.13■■□□□ 1.29
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ODC1-201ENST00000234111 KIF5BP33176 963 aa23.12■■□□□ 1.29
ODC1-201ENST00000234111 SLC5A9Q2M3M2 681 aa23.12■■□□□ 1.29
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ODC1-201ENST00000234111 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
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ODC1-201ENST00000234111 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
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ODC1-201ENST00000234111 MFN1Q8IWA4 741 aa23.12■■□□□ 1.29
ODC1-201ENST00000234111 ITFG2Q969R8 447 aa23.12■■□□□ 1.29
ODC1-201ENST00000234111 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
ODC1-201ENST00000234111 CCDC113Q9H0I3 377 aa23.12■■□□□ 1.29
ODC1-201ENST00000234111 HGSO14964 777 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
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