RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225603.8

CBX1-201, Transcript of chromobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX1, Length 2,232 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-201ENST00000225603 UGCGQ16739 394 aa20.12■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 GSDMAQ96QA5 445 aa20.12■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 SLC9A2Q9UBY0 812 aa20.12■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 DNM3Q9UQ16 869 aa20.12■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 WDR64B1ANS9 1081 aa20.12■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 TBC1D8O95759 1140 aa20.12■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 PTGS1P23219 599 aa20.12■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 SLC12A3P55017 1021 aa20.12■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 MAP2K5Q13163 448 aa20.12■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 SARM1Q6SZW1 724 aa20.12■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 P4HBP07237 508 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 JAK3P52333 1124 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 DYMQ7RTS9 669 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 USP6NLQ92738 828 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 GJD2Q9UKL4 321 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 BECN2A8MW95 431 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 TGFB3P10600 412 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 SFNP31947 248 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 ACTR2P61160 394 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 AMPD3Q01432 767 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 CCDC62Q6P9F0 684 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 KATNBL1Q9H079 304 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 MYL1P05976 194 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 CDC25BP30305 580 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 TERF1P54274 439 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 ASIC1P78348 528 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 ARSHQ5FYA8 562 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 TAPT1Q6NXT6 567 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 DDX12PQ92771 950 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 EYA4O95677 639 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 GGPS1O95749 300 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 CYP11B2P19099 503 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 QARSP47897 775 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 CAP1Q01518 475 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 ABHD15Q6UXT9 468 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 GPBP1Q86WP2 473 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 DRC7Q8IY82 874 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 NEK9Q8TD19 979 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 COPS5Q92905 334 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 TINF2Q9BSI4 451 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 ZNF236Q9UL36 1845 aa20.09■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 TPM2P07951 284 aa20.09■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 MUTP22033 750 aa20.09■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 RDM1Q8NG50 284 aa20.09■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.09■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.09■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 SPTLC3Q9NUV7 552 aa20.09■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.09■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 CYP2B6P20813 491 aa20.08■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa20.08■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 NEDD9Q14511 834 aa20.08■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 CCL14Q16627 93 aa20.08■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 NACC1Q96RE7 527 aa20.08■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 RUSC1Q9BVN2 902 aa20.08■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 GABBR1Q9UBS5 961 aa20.08■□□□□ 0.81
CBX1-201ENST00000225603 PCNTO95613 3336 aa20.08■□□□□ 0.8
CBX1-201ENST00000225603 TMEM150BA6NC51 233 aa20.08■□□□□ 0.8
CBX1-201ENST00000225603 HOXC6P09630 235 aa20.08■□□□□ 0.8
CBX1-201ENST00000225603 CD44P16070 742 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
CBX1-201ENST00000225603 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
CBX1-201ENST00000225603 SWSAP1Q6NVH7 229 aa20.08■□□□□ 0.8
CBX1-201ENST00000225603 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
CBX1-201ENST00000225603 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
CBX1-201ENST00000225603 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
CBX1-201ENST00000225603 AOPEPQ8N6M6 819 aa20.08■□□□□ 0.8
CBX1-201ENST00000225603 TRIM47Q96LD4 638 aa20.08■□□□□ 0.8
CBX1-201ENST00000225603 PYCARDQ9ULZ3 195 aa20.08■□□□□ 0.8
CBX1-201ENST00000225603 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa20.08■□□□□ 0.8
CBX1-201ENST00000225603 TRPA1O75762 1119 aa20.07■□□□□ 0.8
CBX1-201ENST00000225603 TXNP10599 105 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CBX1-201ENST00000225603 PSMC4P43686 418 aa20.07■□□□□ 0.8
CBX1-201ENST00000225603 PSMC5P62195 406 aa20.07■□□□□ 0.8
CBX1-201ENST00000225603 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CBX1-201ENST00000225603 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms